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别名
DMT-dG(ib)酰胺|N-(2-甲基-1-丙酮基)-5'-O-[双(4-甲氧苯基)苯甲基]-2'-脱氧鸟苷|3'-[2-氰乙基N,N-双(1-甲基乙基)亚磷酰胺]|N2-异丁酰-5'-O-(4,4'-双甲氧基三基)-2'-脱氧鸟苷-3'-O-[O-(2-氰乙基)-N,N'-二异丙基亚磷酰胺]|鸟嘌呤核苷5'-O-[双(4-甲氧苯基)苯甲基]-2'-脱氧胞-N-(2-甲基-1-丙酮基)|N2-异丁酰基-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2'-脱氧尿苷-3'-(2-氰乙基-N,N-二异丙基)亚磷酰胺|5'-O-[双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲基]-3'-O-[(2-氰基乙氧基)(二异丙基氨基)膦基]-2'-脱氧-N-异丁酰基尿苷
概述
DMT-dG(ib)亚磷酰胺是一种DNA亚磷酰胺。
主要特点:
环外氨基由苯甲酰基(dA(bz)和dC(bz))或异丁酰基(dG(ib))保护;
对于标准碱基保护的寡核苷酸,建议的切割和脱保护条件为采用浓氨水55 °C处理8小时,或室温处理24小时;
Proligo′s DNA亚磷酰胺的高偶联效率有助于得到高产、高质量的寡核苷酸。
规格
别名
DMT-dG(ib)酰胺 | N-(2-甲基-1-丙酮基)-5'-O-[双(4-甲氧苯基)苯甲基]-2'-脱氧鸟苷 | 3'-[2-氰乙基N,N-双(1-甲基乙基)亚磷酰胺] | N2-异丁酰-5'-O-(4,4'-双甲氧基三基)-2'-脱氧鸟苷-3'-O-[O-(2-氰乙基)-N,N'-二异丙基亚磷酰胺] | 鸟嘌呤核苷5'-O-[双(4-甲氧苯基)苯甲基]-2'-脱氧胞-N-(2-甲基-1-丙酮基) | N2-异丁酰基-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2'-脱氧尿苷-3'-(2-氰乙基-N,N-二异丙基)亚磷酰胺 | 5'-O-[双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲基]-3'-O-[(2-氰基乙氧基)(二异丙基氨基)膦基]-2'-脱氧-N-异丁酰基尿苷
英文别名
5'-O-(4,4-Dimethoxytrityl)-N-isobutyryl-2'-deoxyguanosine-3'-(2-cyanoethyl-N,N-diisopropyl)phosphoramidite | DMT-dG(ib) Phosphoramidite, configured for MerMade | 2'-Deoxy-5'-O-DMT-N2-isobutyrylguanosine 3'-CE phosphoramidite | DMT-dG(ib) Phosphoramidite | DMT-dG(ib) Pharmadite(R) | N-[9-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]m 展开
英文名称
DMT-dG(ib) Phosphoramidite
名称和识别符
IUPAC Name
N-[9-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]-6-oxo-1H-purin-2-yl]-2-methylpropanamide
INCHI
1S/C44H54N7O8P/c1-28(2)41(52)48-43-47-40-39(42(53)49-43)46-27-50(40)38-25-36(59-60(57-24-12-23-45)51(29(3)4)30(5)6)37(58-38)26-56-44(31-13-10-9-11-14-31,32-15-19-34(54-7)20-16-32)33-17-21-35(55-8)22-18-33/h9-11,13-22,27-30,36-38H,12,24-26H2,1-8H3,(H2,47,48,49,52,53)/t36-,37+,38+,60?/m0/s1
InChi Key
FDRMKYVTIFSDPR-MMROLVBFSA-N
Smiles
CC(C)C(=O)NC1=NC2=C(C(=O)N1)N=CN2C3CC(C(O3)COC(C4=CC=CC=C4)(C5=CC=C(C=C5)OC)C6=CC=C(C=C6)OC)OP(N(C(C)C)C(C)C)OCCC#N
Isomeric SMILES
CC(C)C(=O)NC1=NC2=C(C(=O)N1)N=CN2[C@H]3C[C@@H]([C@H](O3)COC(C4=CC=CC=C4)(C5=CC=C(C=C5)OC)C6=CC=C(C=C6)OC)OP(N(C(C)C)C(C)C)OCCC#N
Reaxys-RN link address
https://www.reaxys.com/reaxys/secured/hopinto.do?context=S&query=IDE.XRN=44146117&ln=
高级数据
系统学分类
| 界(kingdom) |
有机化合物 |
| 超类(Superclass) |
苯类化合物 |
| 类(Class) |
三苯化合物 |
| 亚类(Subclass) |
暂无 |
| 中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) |
暂无 |
| 直接上位类(Direct Parent) |
三苯化合物 |
| 其他上位类(Alternative Parents) |
核糖核苷亚磷酰胺 6-氧嘌呤 次黄嘌呤 苄醚 苯氧基化合物 茴香醚 N-芳基酰胺 甲氧基苯 嘧啶酮类 烷基芳基醚 N-取代咪唑 乙烯基酰胺 氧杂环戊烷 杂芳族化合物 仲羧酸酰胺 氧环化合物 氮杂环化合物 腈类 二烷基醚 有机氧化物 羰基化合物 有机光子化合物 碳氢化合物衍生物 |
| 分子骨架(Molecular Framework) |
芳香族杂多环化合物 |
| 取代基(Substituents) |
6-羰基嘌呤 - 芳基醚 - 茴香醚 - 芳香族杂多环化合物 - 氮杂环 - 吡唑 - 苄基醚 - 碳腈 - 羰基 - 羧酰胺基 - 羧酸衍生物 - 氰化物 - 二烷基醚 - 乙醚 - 杂芳香族化合物 - 烃衍生物 - 嘌呤 - 咪唑 - 咪唑哌啶 - 甲氧基苯 - 单环苯基基团 - N-芳基酰胺 - N-取代咪唑 - 氰基化合物 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机杂环化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 氧杂环 - 氧杂环丁烷 - 苯酚醚 - 苯氧基化合物 - 鸟苷酸 - 嘧啶 - 嘧啶酮 - 核糖核苷磷酰胺酯 - 醛基 - 三苯基化合物 - 乙烯酰胺 |
| 描述(Description) |
该化合物属于有机化合物中的三苯基化合物类。这类芳香化合物含有三苯基结构单元。 |
| 外部描述符(External Descriptors) |
暂无 |
化学和物理性质
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
2
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
12
可旋转键计数Rotatable Bond Count
19
精确质量Exact Mass
839.377 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
839.377 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
171.000 Ų
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
3
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
1
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
安全和危险性(GHS)
预防措施声明
P280: 戴防护手套/穿防护服/戴防护眼罩/戴防护面具。
P305+P351+P338: 如进入眼睛:用水小心冲洗几分钟。如戴隐形眼镜并可方便地取出,取出隐形眼镜。继续冲洗。
P264+P265: 处理后彻底洗手[和…]。不要触摸眼睛。
P337+P317: 如果眼睛刺激持续:寻求医疗帮助。
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
技术文档和文章
溶液计算器
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