Pinometostat (EPZ5676), 类组蛋白赖氨酸甲基转移酶 DOT1 抑制剂

CAS: 1380288-87-8 货号: E125307 分子式: C30H42N8O3 分子量: 562.71
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文献证明

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概述

EPZ-5676是氨基核苷类DOT1L组蛋白甲基转移酶抑制剂,Ki为80 pM,比对其它多种PMTs的抑制性高37000倍。

Pinometostat (EPZ5676) is an S-adenosyl methionine (SAM) competitive inhibitor of protein methyltransferase DOT1L with Ki of 80 pM in a cell-free assay, demonstrating >37,000-fold selectivity against all other PMTs tested, inhibits H3K79 methylation in tumor.

规格

英文别名
(2R,3R,4S,5R)-2-(6-Amino-9H-purin-9-yl)-5-(((3-(2-(5-(tert-butyl)-1H-benzo[d]imidazol-2-yl)ethyl)cyclobutyl)(isopropyl)amino)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diol | Q27277695 | rel-N1-[(1R,2S)-2-Phenylcyclopropyl]-1,4-cyclohexanediamine hydrochloride (1:2) | SC
规格或纯度
Moligand™, ≥98%
英文名称
Pinometostat (EPZ5676)
生化机理
该化合物的 Ki 值为 80 pM,与测试的所有其他甲基转移酶相比,具有 37,000 倍的选择性。在细胞研究中,EPZ-5676 可抑制 H3K79 甲基化和 MLL 融合靶基因的表达,并对带有 MLL 易位的急性白血病株具有选择性的强效细胞杀伤作用。
储存条件
-20°C储存
运输条件
超低温运输
作用类型
抑制剂
作用机制
类组蛋白赖氨酸甲基转移酶 DOT1 抑制剂
纯度
≥98%
名称和识别符
PubChem SID
分子类型
小分子
IUPAC Name
(2R,3R,4S,5R)-2-(6-aminopurin-9-yl)-5-[[[3-[2-(6-tert-butyl-1H-benzimidazol-2-yl)ethyl]cyclobutyl]-propan-2-ylamino]methyl]oxolane-3,4-diol
INCHI
1S/C30H42N8O3/c1-16(2)37(13-22-25(39)26(40)29(41-22)38-15-34-24-27(31)32-14-33-28(24)38)19-10-17(11-19)6-9-23-35-20-8-7-18(30(3,4)5)12-21(20)36-23/h7-8,12,14-17,19,22,25-26,29,39-40H,6,9-11,13H2,1-5H3,(H,35,36)(H2,31,32,33)/t17?,19?,22-,25-,26-,29-/m1/s1
InChi Key
LXFOLMYKSYSZQS-XKHGBIBOSA-N
Smiles
CC(C)N(CC1C(C(C(O1)N2C=NC3=C(N=CN=C32)N)O)O)C4CC(C4)CCC5=NC6=C(N5)C=C(C=C6)C(C)(C)C
Isomeric SMILES
CC(C)N(C[C@@H]1[C@H]([C@H]([C@@H](O1)N2C=NC3=C(N=CN=C32)N)O)O)C4CC(C4)CCC5=NC6=C(N5)C=C(C=C6)C(C)(C)C
分子量
562.71
Reaxy-Rn
28683701
Reaxys-RN link address
https://www.reaxys.com/reaxys/secured/hopinto.do?context=S&query=IDE.XRN=28683701&ln=

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高级数据

系统学分类

分类树(Taxonomy Tree)

界(kingdom) 有机化合物
超类(Superclass) 核苷、核苷酸及其类似物
类(Class) 5'-脱氧核糖核苷
亚类(Subclass) 暂无
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) 暂无
直接上位类(Direct Parent) 5'-脱氧核糖核苷
其他上位类(Alternative Parents) 糖胺  戊糖  6-氨基嘌呤  苯并咪唑类  氨基嘧啶及其衍生物  芳烷基胺  N-取代咪唑  咪唑内酰胺类  苯类化合物  四氢呋喃  杂芳族化合物  三烷基胺  仲醇  1,2-二醇  氧环化合物  氮杂环化合物  有机光子化合物  碳氢化合物衍生物  伯胺  
分子骨架(Molecular Framework) 芳香族杂多环化合物
取代基(Substituents) 1,2-二醇 - 5'-脱氧核糖核苷 - 6-氨基嘌呤 - 羟基苯甲酸酯 - 氨基酸 - 氨基吡啶 - 芳烷基胺 - 芳香族杂多环化合物 - 氮杂环 - 吡唑 - 苯基化合物 - 苯并咪唑 - 糖基化合物 - 杂芳香族化合物 - 烃衍生物 - 咪唑 - 咪唑哌啶 - 咪唑内酰胺 - 单糖 - N-羧酰胺基-α-氨基酸或其衍生物 - N-取代咪唑 - 有机硝基化合物 - 有机氧化合物 - 有机杂环化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 氧杂环 - 五碳单糖 - 初级胺 - 鸟苷酸 - 嘧啶 - 醛基 - 三元脂肪胺 - 三芳基胺 - 四氢呋喃
描述(Description) 该化合物属于有机化合物中的5'-脱氧核苷类。此类核苷的核糖分子5'位氧原子被其他原子取代,其核碱基仅限于嘌呤、嘧啶及吡啶衍生物。
外部描述符(External Descriptors) 暂无
三维结构
交互式化学结构模型





关联靶点(人)
DOT1L Tchem 组蛋白赖氨酸 N-甲基转移酶,H3 赖氨酸-79 特异性(Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-79 specific) (2 活性数据)
活性类型 活性值-log(M) 作用机制 期刊 参考文献(PubMed IDs)
化学和物理性质
溶解性
≥28.15 mg/mL in DMSO; insoluble in H2O; ≥50.3 mg/mL in EtOH with ultrasonic
分子量
562.700 g/mol
XLogP3
4.300
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
4
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
9
可旋转键计数Rotatable Bond Count
9
精确质量Exact Mass
562.338 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
562.338 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
151.000 Ų
重原子数Heavy Atom Count
41
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
884.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
4
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
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批号(Lot Number) 证书类型 货号
C23311055 分析证书 E125307
C2331521 分析证书 E125307
C2331523 分析证书 E125307
C2331548 分析证书 E125307
C2331549 分析证书 E125307
C2331550 分析证书 E125307
C2331552 分析证书 E125307
C2331553 分析证书 E125307
A2616038 分析证书 E125307
C2331547 分析证书 E125307
C2331551 分析证书 E125307
C2331470 分析证书 E125307
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