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从硝基芳烃到药物相关吡啶:光诱导芳基氮宾介导的骨架编辑策略

1 研究来源与核心问题

 

1.1 研究对象

Saha、Pan、Ghosh、Pal、Guin、Redhu、Gota 和 Maiti 报道的研究 A General Strategy to Access Pharmaceutically Relevant Pyridines from Nitroarenes,提出了一种从硝基芳烃直接获得药物相关吡啶杂环的合成策略。该研究发表于 Angewandte Chemie International Edition,DOI 为 10.1002/anie.202517867。

 

        这项研究的核心是将硝基芳烃经过光诱导氮宾转化、芳环重排和选择性碳删除,转化为吡啶骨架。其本质属于芳香骨架编辑:不是在芳环外围增加官能团,而是改变芳环内部的原子组成和连接方式。

 

1.2 合成问题

        吡啶是药物分子中高频出现的含氮芳香杂环。与苯环相比,吡啶环中的氮原子可以改变分子的电子分布、氢键受体能力、极性、溶解度和代谢性质。在药物化学中,将苯环替换为吡啶常用于调节分子性质和探索构效关系(structure–activity relationship,SAR)。

 

        传统吡啶合成通常依赖含氮砌块缩合、环化或多步杂环构建。对于简单分子,这些方法成熟有效;但对于复杂药物分子或后期类似物修饰,重新搭建吡啶环往往会增加路线长度,并限制底物适用范围。

 

        上述研究要解决的问题是:能否直接利用稳定、易得的硝基芳烃,将原有芳环改造成吡啶骨架,从而快速获得药物相关吡啶类似物?

 

2 关键结构与反应总体设计

 

2.1 重要结构示意

 

结构名称

结构式示意

分子式

说明

硝基芳烃

Ar–NO₂

取决于 Ar

反应原料;硝基既是可激活官能团,也是进入吡啶骨架的氮源

硝基苯

Ph–NO₂

C₆H₅NO₂

硝基芳烃的母体结构

吡啶

C₅H₅N

C₅H₅N

六元含氮芳香杂环,常见药物骨架

2-氨基吡啶

H₂N–C₅H₄N

C₅H₆N₂

重要药物化学砌块,可作为氢键供体和受体结构单元

 

2.2 反应设计示意

该反应可以概括为以下级联过程:

 

 

 

3 光化学与铁-卟啉催化剂的作用分工

 

3.1 光化学负责生成关键单线态氮宾

        硝基芳烃是相对稳定且易获得的芳香化合物。要将其芳香骨架改写为吡啶,首先需要使硝基芳烃脱离常规的还原、取代或偶联反应路径,进入能够发生氮原子插入和环扩张的高活性中间体过程。

 

        该研究利用近紫外/蓝光 LED 条件使硝基芳烃发生光激发,并经系间窜越(intersystem crossing,ISC)形成三线态激发态。该激发态硝基芳烃具有亲电性 O-自由基特征,随后与富电子三价磷试剂发生选择性脱氧,生成关键的单线态芳基氮宾中间体。

 

        单线态芳基氮宾具有较高反应活性,可插入芳香环形成去芳构化中间体。该中间体随后经 6π 电环化开环形成七元酮亚胺,并在胺捕获和异构化后生成 3H-氮杂环庚三烯中间体。3H-氮杂环庚三烯是后续生成 2-氨基吡啶或未取代吡啶的关键分支中间体。

 

        光化学在该体系中的作用不是简单提供反应能量,而是将稳定硝基芳烃转化为单线态氮宾,使反应从普通官能团转化进入芳香骨架编辑过程。

 

3.2 铁-卟啉催化剂调控氧参与的 C5-碳删除过程

        该研究采用铁-卟啉催化体系调控单线态氧(singlet oxygen,¹O₂)参与后续环编辑过程。该催化剂的结构和功能设计借鉴了天然血红素酶中的铁-卟啉活性中心。天然血红素体系能够通过铁中心与卟啉配体协同作用实现氧分子的结合和活化。

 

        在该反应中,铁-卟啉催化剂的主要作用是在氮杂环庚三烯中间体形成后,调控单线态氧参与后续氧化重排和环收缩过程,使反应沿 C5-碳删除路径生成 2-氨基吡啶衍生物。该催化体系的价值在于调控氧参与的 C5-碳删除级联过程,从而改善 2-氨基吡啶路径的转化效率和选择性。

 

环节

主要作用

对结果的影响

光照

生成氮宾中间体

启动芳环骨架编辑

三价膦试剂

促进硝基脱氧

推动氮宾形成

铁-卟啉催化剂

调控单线态氧

提高 C5-碳删除路径效率

单线态氧

参与环收缩和氧化重排

促进 2-氨基吡啶生成

 

4 反应机理的核心逻辑

 

4.1 从硝基到氮宾:硝基成为内置氮源

        传统硝基芳烃反应常见路径包括还原为芳胺、参与偶联或作为吸电子取代基影响芳环反应。该研究的不同之处在于,硝基不是被简单转化为外围官能团,而是被转化为氮宾,并进一步进入杂环骨架。

 

这一点改变了硝基芳烃的合成意义:

传统理解:硝基芳烃 = 芳环上的可转化官能团

此研究中的理解:硝基芳烃 = 可重构为吡啶骨架的含氮芳香前体

 

        这也是该方法的逆合成价值。面对目标吡啶结构时,研究者可以考虑是否存在对应的硝基芳烃前体,并通过骨架编辑完成芳烃到吡啶的转化。

 

4.2 从氮宾到氮杂环庚三烯:芳环进入可编辑状态

        单线态氮宾生成后,会与芳香环发生分子内反应,形成去芳构化中间体。随后经过 6π 电环化开环,生成七元氮杂环中间体,即 3H-氮杂环庚三烯。该中间体是反应分流的关键节点。它既保留了原芳环的部分碳骨架,又具备进一步重排和收缩的反应活性。

 

4.3 从七元环到吡啶:选择性碳删除决定产物类型

吡啶由五个碳原子和一个氮原子组成,而苯环含六个碳原子。硝基芳烃转化为吡啶,本质上需要完成两个变化:

①将氮引入芳香环骨架;

②从原有碳骨架中选择性删除一个碳原子。

 

该研究中存在两条主要路径:

 

路径

关键参与物

碳删除方式

主要产物

路径 A

胺类亲核试剂 + 铁-卟啉/氧参与体系

C5-碳删除

2-氨基吡啶

路径 B

N-乙基乙醇胺等氨基醇捕获体系

本位碳删除,即删除原芳环中连接硝基的碳

相应吡啶衍生物

 

        这两条路径的重要性在于,它们不是产生同一种吡啶产物,而是通过不同的碳删除模式进入不同取代类型的吡啶结构。对于药物化学而言,这种产物分流能力有助于快速制备结构相近但性质不同的吡啶类似物。

 

5 合成价值:从芳烃库到吡啶库

 

5.1 原料来源具有实际意义

        硝基芳烃来源广泛,许多芳香化合物可以通过硝化或前体转化获得相应硝基芳烃。与不稳定的叠氮化物或特殊含氮前体相比,硝基芳烃通常更稳定,也更容易保存和操作。该策略的合成价值是把已有硝基芳烃资源转化为潜在吡啶产物资源。

 

5.2 产物覆盖药物相关吡啶结构

        该研究报道了多种 2-氨基吡啶衍生物以及经 ipso-碳删除获得的吡啶衍生物,包括不同取代模式的 2-氨基吡啶、稠合吡啶以及复杂分子衍生吡啶。部分底物来源于药物或生物活性分子衍生物,说明该方法可以用于后期骨架改造。对于药物发现阶段,该方法的价值体现在三个方面:

 

药物化学需求

该方法的对应价值

快速制备吡啶类似物

从硝基芳烃直接获得吡啶骨架,减少重新设计路线的需求

探索苯环到吡啶替换

用吡啶氮调节电子性质、极性和氢键作用

后期结构改造

在复杂分子中引入吡啶骨架,用于 SAR 研究

 

6 药物设计意义

 

6.1 吡啶氮改变分子性质

        苯环到吡啶的替换常被视为生物电子等排替换。吡啶氮的孤对电子不参与芳香六π电子体系,可以作为氢键受体与蛋白靶点相互作用。同时,吡啶氮会降低芳环电子密度,提高分子极性,并可能改变代谢位点。这种结构变化可能带来以下影响:

 

结构变化

可能影响

芳环中引入氮原子

改变电子分布和偶极矩

形成氢键受体位点

改变靶点结合模式

增加分子极性

影响水溶性和膜通透性

改变芳环代谢倾向

影响代谢稳定性

 

        这些影响并非一定带来活性提高,但它们为药物化学优化提供了明确变量。该方法的价值正是快速获得这些变量对应的化合物。

 

6.2 尼美舒利案例的意义

        研究中以尼美舒利相关结构作为应用案例。尼美舒利含硝基芳香结构,硝基与潜在安全性风险相关。通过将硝基芳香片段转化为吡啶相关骨架,可以获得新的类似物,用于比较靶点结合和分子性质变化。

 

        该方法不仅适用于简单模型底物,也可以用于药物相关分子的结构改造。研究通过分子对接和 COX-2 结合相关测试评价改造后分子与靶标的相互作用,显示该策略具有药物化学应用潜力。需要注意的是,该结果属于方法学应用验证。分子对接和体外结合数据能够说明结构改造可能改善靶标相互作用,但不能直接等同于药效、安全性或临床价值的全面提升。

 

7 方法适用性的关键判断

 

该反应具有明显创新性,但实际使用时需要根据底物和研究目的判断适用性。

 

判断项目

关键问题

对应用的影响

底物结构

硝基芳烃的硝基位置、取代基电子效应、空间位阻是否有利于光脱氧生成氮宾、芳环插入、环扩张和选择性碳删除

影响氮宾形成效率、环扩张过程、转化率和区域选择性

取代模式与区域选择性

邻位、间位、对位取代是否可能导致不同碳删除位置或异构体生成

决定目标吡啶产物是否单一、是否易分离

产物类型

目标产物是 2-氨基吡啶衍生物,还是经 ipso-碳删除获得的吡啶衍生物

决定后续选择 C5-碳删除路径或ipso-碳删除路径

亲核试剂选择

使用胺类亲核试剂,还是使用 N-乙基乙醇胺等氨基醇捕获体系

影响 3H-氮杂环庚三烯中间体的捕获方式,并决定产物分流

光化学条件

光源波长、光强、反应器结构、反应浓度和光照时间是否可稳定复制

影响硝基芳烃激发、脱氧和氮宾生成效率

氧参与过程

目标是否为 2-氨基吡啶路径,是否需要有效单线态氧参与 C5-碳删除

影响 C5-碳删除效率和 2-氨基吡啶产率

催化体系

铁-卟啉催化剂的类型、用量、纯度和可获得性是否满足反应要求

影响单线态氧利用效率、反应选择性和实验可重复性

官能团兼容性

底物中是否含有易被光、氧、磷试剂或活性中间体影响的官能团

决定复杂底物、药物分子或后期修饰底物是否适用

放大可行性

反应目标是毫克级药物化学筛选,还是克级以上路线开发

决定对产率、光照传递、氧气控制、纯化和安全性的要求

 

8 硝基芳烃到药物相关吡啶骨架编辑策略相关产品分类表

 

表1. 硝基芳烃底物与硝基芳烃衍生物

 

分类

Cas编号

阿拉丁货号

名称

规格或纯度

产品特色与应用

母体硝基芳烃

98-95-3

N116219

硝基苯

ACS, ≥99%(GC)

基础硝基芳烃底物,用于光脱氧生成芳基氮宾及芳环骨架编辑模型研究

烷基取代硝基芳烃

88-72-2

N104633

邻硝基甲苯

≥99%

邻位烷基取代底物,用于考察空间位阻对氮宾插入、环扩张和区域选择性的影响

烷基取代硝基芳烃

99-08-1

N105604

间硝基甲苯

化学纯(CP)

间位烷基取代底物,用于研究取代位置对碳删除方向和吡啶异构体形成的影响

烷基取代硝基芳烃

99-99-0

N104645

对硝基甲苯

≥99%

对位烷基取代底物,用于芳基氮宾生成、取代效应和吡啶骨架转化研究

甲氧基取代硝基芳烃

91-23-6

N108657

2-硝基苯甲醚

≥98%

邻位甲氧基取代底物,用于给电子取代基和邻位效应对骨架编辑路径的影响研究

甲氧基取代硝基芳烃

555-03-3

N159810

3-硝基苯甲醚

——

间位甲氧基取代底物,用于间位取代硝基芳烃的区域选择性和产物分布研究

甲氧基取代硝基芳烃

100-17-4

N105584

对硝基苯甲醚

≥98%

对位甲氧基取代底物,用于给电子取代基对光脱氧和芳基氮宾反应活性的影响研究

羧酸取代硝基芳烃

62-23-7

N433134

4-硝基苯甲酸

适用于合成

羧酸取代硝基芳烃,用于羧基官能团耐受性和吡啶羧酸类结构前体研究

酯基取代硝基芳烃

619-50-1

E106598

4-硝基苯甲酸甲酯

≥99%

酯基取代硝基芳烃,用于药物相关吡啶羧酸酯骨架构建研究

醛基取代硝基芳烃

555-16-8

N104181

对硝基苯甲醛

AR, ≥97%(GC)

醛基取代硝基芳烃,用于羰基官能团兼容性和含醛吡啶前体设计研究

氰基取代硝基芳烃

619-72-7

N107605

对硝基苯腈

≥97%

氰基取代硝基芳烃,用于强吸电子取代基对光脱氧、环扩张和产物选择性的影响研究

氨基取代硝基芳烃

100-01-6

N111641

对硝基苯胺

AR, ≥99%

氨基取代硝基芳烃,用于含氮官能团兼容性和多官能团芳香底物研究

酚类硝基芳烃标准品

100-02-7

N128193

对硝基苯酚标准溶液

2000ug/ml in Methanol

硝基酚分析标准品,用于硝基芳烃检测、方法验证和定量分析

卤代硝基芳烃

350-46-9

F107055

1-氟-4-硝基苯

≥98%

氟代硝基芳烃,用于卤素取代底物兼容性和后续官能团转化研究

卤代硝基芳烃

586-78-7

B153155

1-溴-4-硝基苯

≥99%(GC)

溴代硝基芳烃,用于骨架编辑与偶联反应衔接的底物设计研究

卤代硝基芳烃

636-98-6

I107038

4-碘硝基苯

≥98%

碘代硝基芳烃,用于高反应活性卤代芳烃底物和后续交叉偶联位点设计

稠环硝基芳烃

86-57-7

N101000

1-硝基萘

≥99%

稠环硝基芳烃底物,用于稠合吡啶骨架和多环芳香体系骨架编辑研究

稠环硝基芳烃

581-89-5

N770121

2-硝基萘

≥98%

稠环硝基芳烃异构体,用于稠环底物区域选择性和异构体形成研究

 

表2. 光脱氧试剂、亲核捕获试剂与反应溶剂

 

分类

Cas编号

阿拉丁货号

名称

规格或纯度

产品特色与应用

三价磷脱氧试剂

121-45-9

T106149

亚磷酸三甲酯

化学纯(CP), ≥95%

硝基芳烃光脱氧试剂,用于芳基氮宾生成和反应条件优化

三价磷脱氧试剂

122-52-1

T105731

亚磷酸三乙酯

≥98%

三价磷脱氧试剂,用于硝基脱氧、氮宾生成和磷试剂筛选

有机膦对照试剂

603-35-0

T104475

三苯基膦

≥99%(GC)

有机膦还原试剂,用于脱氧反应对照、膦试剂筛选和机理研究

胺类亲核试剂

109-89-7

D110469

二乙胺

精馏级, ≥99.5%

胺类亲核捕获试剂,用于氮杂环庚三烯中间体生成和2-氨基吡啶路径研究

氨基醇亲核试剂

141-43-5

E103808

乙醇胺

精馏级, ≥99.5%

氨基醇类参考试剂,可用于氨基醇捕获体系设计和条件筛选参考

无水醚类溶剂

109-99-9

T1491789

四氢呋喃(THF)

无水级, ≥99.9%, 无稳定剂,H2O≤30ppm

光化学脱氧和水敏体系常用无水溶剂,用于氮宾生成反应和条件筛选

无水极性溶剂

75-05-8

A119012

无水乙腈(ACN)

无水级, ≥99.8%, H2O≤0.003%

极性无水溶剂,用于光化学反应、氧参与反应和反应体系筛选

卤代烃溶剂

75-09-2

D433567

二氯甲烷

适用于分析, ACS

卤代烃溶剂,用于卟啉配合物溶解、反应筛选、萃取和分析前处理

 

表3. 卟啉配体、金属卟啉催化剂与铁源试剂

 

分类

Cas编号

阿拉丁货号

名称

规格或纯度

产品特色与应用

卟啉配体

917-23-7

M115647

meso-四苯基卟吩(TPP)

≥99%, Chlorin free

卟啉配体,用于金属卟啉催化剂制备、氧活化模型和光氧化反应研究

铁-卟啉催化剂

16456-81-8

T189043

间-四苯基卟啉氯化铁(III)

≥95%

铁-卟啉催化剂,用于单线态氧参与的C5-碳删除和2-氨基吡啶形成研究

锰-卟啉催化剂

32195-55-4

T303433

四苯基卟啉氯化锰(III)

≥95%

锰-卟啉配合物,用于金属卟啉催化剂筛选和氧参与反应对照研究

钴-卟啉催化剂

14172-90-8

C190873

四苯基卟啉钴(II)

≥95%

钴-卟啉配合物,用于金属中心效应比较和氧活化相关反应研究

铁源试剂

7705-08-0

I112064

无水三氯化铁

≥99.9% metals basis

高纯铁源试剂,用于铁配合物制备、金属杂质控制实验和催化体系对照

 

表4. 吡啶母核、氨基吡啶与功能化吡啶砌块

 

分类

Cas编号

阿拉丁货号

名称

规格或纯度

产品特色与应用

吡啶母核

110-86-1

P111513

吡啶

无水级, ≥99.8%

吡啶基础结构单元,用于吡啶骨架性质对照、衍生化反应和药物化学研究

氨基吡啶砌块

504-29-0

A105221

2-氨基吡啶(2-AP)

化学纯(CP)

2-氨基吡啶代表产物,用于氨基吡啶骨架构建、衍生化和靶点结合研究

氨基吡啶砌块

462-08-8

A107134

3-氨基吡啶

≥99%

氨基吡啶异构体,用于氨基取代位置效应和吡啶类似物对照研究

氨基吡啶砌块

504-24-5

A113920

4-氨基吡啶

≥98%

氨基吡啶异构体,用于吡啶氨基位置效应、氢键作用和结构活性关系研究

卤代吡啶砌块

109-09-1

C104870

2-氯吡啶

≥98%

氯代吡啶砌块,用于亲核取代、偶联反应和吡啶类似物合成

卤代吡啶砌块

109-04-6

B109679

2-溴吡啶

≥98%

溴代吡啶砌块,用于交叉偶联、官能团延伸和吡啶骨架衍生化

氰基吡啶砌块

100-70-9

P106583

2-氰基吡啶

≥98%

氰基吡啶砌块,用于吡啶羧酸、吡啶酰胺及含氮杂环衍生物合成

吡啶羧酸砌块

59-67-6

N433036

烟酸

适用于合成, Moligand™

3-吡啶羧酸砌块,用于烟酸类衍生物、酰胺化反应和药物相关吡啶结构研究

吡啶羧酸砌块

55-22-1

I101094

异烟酸 (IN)

AR, Moligand™, ≥99%

4-吡啶羧酸砌块,用于异烟酰胺、异烟肼和吡啶羧酸衍生物合成

吡啶羧酸酯砌块

93-60-7

M120395

烟酸甲酯

≥99%

3-吡啶羧酸酯砌块,用于酯水解、酰胺化和烟酸衍生物合成

吡啶羧酸酯砌块

2459-09-8

M157816

异烟酸甲酯

≥98%

4-吡啶羧酸酯砌块,用于异烟酸衍生物和药物中间体合成

药物相关吡啶分子

54-85-3

I104692

异烟肼

≥99%

吡啶酰肼类药物分子,用于药物相关吡啶产物对照和酰肼结构衍生化研究

药物相关吡啶分子

535-83-1

T345622

葫芦巴碱

Moligand™, ≥98%

烟酸季铵盐衍生物,用于吡啶氮季铵化结构、生物活性分子和对照品研究

 

表5. 药物相关复杂分子、潜在衍生化母体与后期修饰参考化合物

 

分类

Cas编号

阿拉丁货号

名称

规格或纯度

产品特色与应用

甾体复杂分子

57-88-5

C432977

胆固醇、植物的

≥98%

甾体复杂骨架分子,用于复杂分子衍生化、后期修饰和硝基芳烃衍生底物设计

芳基丙酸类药物

15687-27-1

I129291

布洛芬

Moligand™, ≥98%(GC)

芳基丙酸类药物分子,用于药物衍生硝基芳烃底物和吡啶类似物设计

对氨基苯甲酸酯类药物

94-09-7

E107204

4-氨基苯甲酸乙酯

≥99%

芳香酯类药物分子,用于芳香药物骨架衍生化和后期官能化研究

含硝基芳香药物

51803-78-2

N159746

尼美舒利

Moligand™, ≥98%(HPLC)

含硝基芳香药物分子,用于硝基芳烃骨架编辑、硝基替换和吡啶类似物研究

含杂环药物分子

113665-84-2

M637412

氯吡格雷

Moligand™, ≥97%

含杂环复杂药物分子,用于药物骨架后期修饰和吡啶类似物对照研究

芳氧基芳基胺类药物

56296-78-7

F131623

氟西汀 盐酸盐

≥98%(HPLC)

芳氧基芳基胺类药物分子,用于复杂药物骨架后期官能化和含氮杂环替换研究

芳氧基芳基胺类药物

82248-59-7

A129721

盐酸托莫西汀

≥98%

芳氧基芳基胺类药物分子,用于药物类似物设计、芳香骨架替换和后期修饰研究

 

注:以上为阿拉丁代表性科研及配方研究相关产品,更多产品规格、级别、COA信息可用“品名/CAS/货号”在阿拉丁官网检索。

 

参考文献

 

[1] Saha, A.; Pan, A.; Ghosh, D.; Pal, A.; Guin, S.; Redhu, A. K.; Gota, V.; Maiti, D. A General Strategy to Access Pharmaceutically Relevant Pyridines from Nitroarenes. Angew. Chem. Int. Ed. 2025, e17867; final issue: 2026, 65, e17867. DOI: 10.1002/anie.202517867.

 

[2] Dwivedi, A. R.; Jaiswal, S.; Kukkar, D.; Kumar, R.; Singh, T. G.; Singh, M. P.; Gaidhane, A. M.; Lakhanpal, S.; Prasad, K. N.; Kumar, B. A decade of pyridine-containing heterocycles in US FDA approved drugs: a medicinal chemistry-based analysis. RSC Med. Chem. 2025, 16, 12–36. DOI: 10.1039/D4MD00632A.

 

[3] Sharma, R.; Arisawa, M.; Takizawa, S.; Salem, M. S. H. Remodelling molecular frameworks via atom-level surgery: recent advances in skeletal editing of (hetero)cycles. Org. Chem. Front. 2025, 12, 1633–1670. DOI: 10.1039/D4QO02157F.

 

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从哌啶到吡啶:2013–2023 FDA 小分子新药里“最常见含氮杂环”更替与选型导航(表1–4)

 

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引用本文

阿拉丁科学.《从硝基芳烃到药物相关吡啶:光诱导芳基氮宾介导的骨架编辑策略》. 阿拉丁知识库,更新于 2026年7月30日。 https://www.aladdin-e.com/zh_cn/faqs/a-photochemically-induced-aryl-nitrene-mediated-skeletal-editing-strategy.html
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