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吲哚类产品导航:N 位状态、C3 连接口与骨架变体如何映射合成接口与科研用途(表A–E)

一.为什么“都是吲哚”,后续路线却不一样?

        在药物研发、化学生物学与天然产物相关合成里,“吲哚类”经常被当作一类通用的杂环骨架来采购与使用。但实践中最常见的卡点不是“有没有吲哚”, 而是这个吲哚,是否正好对接下一步反应与路线分支:

 

1. 同为吲哚骨架,反应性差别很大:有的可以直接做取代/官能化,有的则需要先保护 N 位点,或先把反应导向到特定位置,否则容易选择性差、副反应多;

 

2. 同为“吲哚类中间体”,后续路线可走的分支不同:例如卤代/硼酸酯更适合做交叉偶联与建库;而 C3-醛/酸/酰胺等更像“侧链连接点”,更适合推进特定骨架的拼接与延伸;

 

3. 同为“吲哚类生物分子”,实验目的不同:用于机制研究与对照时,更关键的是结构一致性、来源与可追溯性、杂质谱可解释性,而不一定追求“最好反应、最好改”。

 

        本文将以 N 位状态、C3 连接口与苯环 4–7 位取代这三处高频结构“旋钮”为主线,解释它们如何决定是否需要 N 保护/封闭、常见反应热点与位点导向,以及后续官能化与交叉偶联的可行性与路线分支;并在此基础上补充“骨架态切换”(吲哚/吲哚啉/氧吲哚体系)这一维度,以此说明同为吲哚相关骨架时酸碱性/成盐能力与反应关注点为何会显著不同(对应表C的二氢吲哚、2-吲哚酮、靛红等代表)。

 

二.什么是吲哚?什么是“吲哚类产品”?

 

2.1 吲哚是什么

        吲哚(indole)是由苯环与含氮五元环稠合形成的芳香杂环。吲哚的 N 为吡咯型氮,孤对电子参与芳香性;因此吲哚极弱碱(文献汇总 pKaH≈−3.6),在常见中性/一般酸性条件下通常保持中性形态。

 

        也正因为该稠合体系电子较富集,吲哚更容易发生亲电芳香取代反应;在多数经典条件下,取代往往优先发生在 3 位(C3),这是吲哚化学中最常用的区域选择性规律之一。

 

        需要强调的是:“C3 优先”主要指亲电芳香取代(EAS)等富电子吲哚的经典反应模式;当进入定向金属化或过渡金属催化的直接 C–H 官能化体系时,位点选择性可能改变,常见策略包括在 N-保护后实现 C2 定向官能化。

 

 

 

2.2 “吲哚类产品”指什么

 

         “吲哚类产品”通常指:分子中含有吲哚母核(indole moiety)的化合物及其直接衍生物。它们的共同点是“带吲哚结构单元”,但会按用途分化为几类常见产品形态:

1. 母核与取代体:用于结构—性质/结构—活性研究或作为合成起点;

2. 保护/活化衍生物:用于提高反应选择性、降低副反应或适配特定反应条件;

3. 带反应把手的中间体:例如带卤素、羧酸/醛等官能团,便于后续偶联、官能团互换与并环构建;

4. 生物活性相关的对照/工具分子:用于机制研究、方法学开发、活性对照与结构验证等。

 

2.3 为什么吲哚特别常见


大家常会在天然产物、药物分子与各类“可继续合成的中间体”里反复遇到吲哚,通常有四个直接原因:

1. 天然来源“先天丰富”:吲哚广泛存在于天然产物与生物活性分子谱系中(包括与色氨酸代谢相关的多类生物分子),为药物与功能分子设计提供了大量可借鉴的母核模板。

2. 相互作用特征“既通用又可微调”:吲哚同时具备芳香 π 体系与 N–H 特征,能在不同靶点环境中形成多样的非共价相互作用;因此在药物化学里常被归为可覆盖多类受体/酶靶点的“优势骨架(privileged scaffold)”。

3. 可改造位点多、SAR 空间大:稠合体系提供多个可取代位置,既能调电子效应、疏水性与代谢稳定性,也能通过官能团把“可偶联/可延伸”能力做成标准化中间体,适合做系统化的结构优化。

4. 合成与官能团化方法成熟:围绕吲哚的构建与定点官能团化已经形成成熟方法学,使其从“天然模板”到“可规模化迭代的化学骨架”转换成本较低,从而进一步放大了其在产品目录中的出现频率。

 

三.结构决定用途:吲哚类产品关键的三处结构点(N 位、C3 位、苯环取代)

 

关键结构点

改变的“性质/反应”(会遇到什么差别)

常见的“产品形态”

常见科研任务

N 位:N–H vs N-取代/保护

在强碱/金属化试剂或需要碱的偶联体系中,N–H 可能被去质子化并引发竞争反应(如 N-烷基化、N-酰化,或与金属/亲电试剂竞争);N-取代/保护常用于降低 N 位干扰、提升位点选择性,并同步影响溶解性与稳定性。

N–H 吲哚;N-烷基吲哚;N-保护吲哚(如 Boc/Cbz/Ts 等)

需要保留/去掉 HBD 来调 ADME;避免副反应以提高选择性;做后续 C2/C3 官能化前的“路线管理”

C3 位:最常见的反应热点/连接口

吲哚在 EAS 中通常 C3 最活泼,因此 C3 官能化常作为“把侧链接上去”的关键节点;C3 的官能团类型直接决定后续转化(延长碳链、引入杂原子、并环等)

3-醛、3-酸/酯、3-腈(以及部分 3-卤/3-酰基等)

快速搭建“吲哚-侧链”骨架;做片段连接、并环/关环前体;SAR 中更换侧链长度与极性

苯环 4/5/6/7 位取代:性质微调与位点导向

主要用于微调 疏水性、电子效应、位阻与代谢稳定性;同时也会影响后续官能化的区域选择性与反应窗口

多位点取代的系列化 产品(如 5-卤/6-卤、甲氧基、氟、硝基、三氟甲基等常见取代)

建库/SAR:用“换位点/换取代基”细调活性与选择性;用卤素等作为后续偶联的“把手”

 

四.吲哚类产品分类总览(骨架态 → 后续合成接口 → 用途场景)

 

分类维度

子类

典型产品形态

主要用途

要点识别

骨架态

吲哚(Indole)

吲哚母核;简单取代吲哚;N–H 吲哚

通用母核起点;做 C3 官能化与骨架衍生

富电子芳香杂环;C3 亲核性强、常为亲电取代热点;N 几乎不显碱性(吡咯型氮)

骨架态

吲哚啉(Indoline,2,3-二氢吲哚)

“更 sp³”的吲哚系列;常见为 N-取代/可成盐形式

用构象与碱性/成盐能力调整溶解度与性质;作为可进一步氧化/官能化的模块

二级胺骨架,与吲哚在酸碱性、反应性和构象上明显不同;更像“可成盐的 sp³ 模块”

骨架态

氧吲哚/吲哚酮(Oxindole/Indolinone)

含羰基的吲哚变体(常见为内酰胺型)

引入极性中心与 H 键模式;常用于特定药效团组合与 3-位构建

从“富电子芳香”切换为含羰基内酰胺;反应关注点常转到羰基与邻位(如 3-位)化学

后续合成接口

交叉偶联入口(建库优先)

2-/3-卤代吲哚(Br/I/Cl);吲哚硼酸/硼酸酯(如 Bpin)

快速扩展取代多样性:Suzuki 等(卤代 ↔ 硼酸(酯)配对);卤代吲哚也常作为 Negishi 等偶联的电离底物

面向“快速搭库/SAR 扫描”,优先看这类;并注意 2-位 vs 3-位把手会影响后续位点规划;硼酸(酯)类要注意稳定性/副反应(如原位水解、脱硼等)

后续合成接口

C3 侧链连接入口(侧链构建优先)

吲哚-3-甲醛;吲哚-3-羧酸/酯;吲哚-3-腈

把侧链接上去:醛→缩合/还原胺化;酸/酯→酰胺化或水解互转;腈→还原得胺/水解到酰胺/酸(视条件)

“选哪种入口”基本决定后续 1–2 步主反应:醛=胺化/缩合,酸/酯=酰胺化,腈=还原或水解路线

后续合成接口

N 位状态与保护(路线可控性优先)

N–H 吲哚;N-保护吲哚(Boc/Cbz/Ts 等);N-烷基化吲哚

控制 N 位相关副反应/选择性;同时通过 N-取代/保护调溶解性、稳定性与相互作用模式

N–H 不处理时常见问题是“N 先去质子化/先被亲电试剂消耗”;选保护基时要把是否需要脱保护、脱保护条件是否温和提前纳入路线设计(例如 Ts 往往更“难脱”,Boc/Cbz 相对更常见于温和路线)

用途场景

建库 / SAR 迭代

卤代/硼酸(酯)系列;位点扫描(4/5/6/7 取代一套)

快速生成一组可比结构,用于结构–活性/性质关系(SAR/性质–活性关系(含溶解度、代谢稳定性等))

关键词:“同骨架、多位点、多取代”;优先选通用可转化的反应入口(最常见是偶联入口,也可含可互转官能团)

用途场景

侧链连接 / 并环与骨架延伸

C3-醛/酸/酯/腈;(需要时)带额外官能团的双反应入口砌块(例如同时带卤代 + 醛/酸等)

用最短步数引入侧链,并为并环/关环留出下一步的连接点

关键词:“连接口明确、下一步反应路径清楚” (胺化/缩合/还原/水解/酰胺化等);双反应入口= 一次拿到两个可串联的入口

用途场景

生物相关对照 / 工具分子

色胺/羟基吲哚/甲氧基吲哚等功能化分子(以及相关衍生物)

机制验证、对照实验、分析方法学评价(定量/回收/基质效应等)

关键词:“结构可追溯 + 用途匹配”;选型优先看纯度等级、标准品/同位素属性,不以“反应活性”作为第一标准

 

五.三条应用主线:吲哚类在研发中高频出现的原因与对应产品形态

 

应用主线

吲哚的核心价值点

典型科研/开发动作

目录里常见的产品形态

药物发现:把“高频骨架”变成可迭代的 SAR 平台

吲哚是药化里典型的优势(privileged)杂环:既能做 π–π/疏水相互作用,又能通过多位点取代系统调性质与活性;N–H 还能提供氢键供体(或通过 N-取代关闭/改写)。

位点扫描(4/5/6/7…);侧链扩展(常围绕 C3);性质优化(溶解度/代谢稳定性/选择性)

卤代/硼酸(酯)吲哚(偶联建库);C3-醛/酸/酯/腈(接侧链);N-保护/ N-取代吲哚(路线管理)

生命化学:高频“生物相关结构单元”与对照/标准品载体

吲哚广泛存在于关键内源分子中;例如 HMDB 将血清素(5-HT)归为吲哚胺(indoleamines),并给出“吲哚环 + 氨基(烷基氨基)侧链”的定义。

机制研究对照(受体/通路);分析方法学标定(定量/回收/基质效应评估);代谢物/信号分子研究

吲哚胺/羟基吲哚/甲氧基吲哚等“功能化内源相关分子”

合成与方法学:从 C3 亲电取代到 C2/C3 官能化的平台

吲哚在亲电取代里常以 C3 为热点,天然适合作为“快速接侧链的反应平台”;同时也有大量工作发展过渡金属催化的直接 C2/C3 芳基化等方法学,用于减少预官能化步骤。

C3 官能化(缩合/还原胺化/酰胺化前体);C2/C3 直接芳基化与后续衍生化

C3-把手型(3-醛/3-酸/3-腈等);卤代/硼酸(酯)型(偶联/位点扩展);“可直接芳基化前体”相关系列

 

六.产品导航表|按科研任务/实验需求定位到吲哚类产品(表A–表E)

 

科研任务/实验需求

建议先看哪张表

为什么先看这张表

典型化学品/用途举例

植物组织培养:生根/愈伤/伸长;做生长素效应对照

表A 植物生长素/植物相关吲哚

这类实验核心是“生长素活性与剂量窗口”,直接需要 IAA/IBA 及其相关前体/衍生物

IAA、IBA;以及用于通路/转化研究的 IAM、IAN、3-吲哚甲醇(I3C)

植物—微生物互作:IAA 生物合成支路验证、前体转化(酰胺/腈→酸)

表A 植物生长素/植物相关吲哚

你要的是“IAA 相关通路中间体/前体”,用于验证转化路径与做分析对照

3-吲哚乙酰胺(IAM)、3-吲哚乙腈(IAN)、IAA;常配合 LC-MS/标准曲线

色氨酸代谢/肠道菌群代谢:做代谢物标准品、定量与代谢组学对照

表B 色氨酸平台与吲哚代谢物

这类工作以“代谢物标准品与定量”优先,B表集中覆盖吲哚胺与常见吲哚代谢物

L-色氨酸、色胺、5-羟色胺、5-HTP、褪黑素、IPA、ILA、吲哚-3-丙酮酸、色醇、3-甲基吲哚

神经递质/受体药理:5-HT 系统、褪黑素系统的体外/细胞实验对照

表B 色氨酸平台与吲哚代谢物

关键是“受体/转运体配体与激素对照”,B表直接给到最常用的生物活性分子

5-羟色胺(5-HT)、褪黑素、色胺、5-HTP(前体)

风味/异味与环境/生物样品检测:skatole 等标志物的 GC/GC-MS 定量

表B 色氨酸平台与吲哚代谢物

目标是“可测、可校准的标志物”,B表里有最常用的吲哚挥发/气味相关代表

3-甲基吲哚(skatole)、色醇(tryptophol)等(配合标准曲线/方法学验证)

药物化学:做“吲哚骨架”先导优化(不以偶联为主),需要母核/取代体/特权骨架

表C 母核/取代/氧化衍生物与天然产物

当要的是“骨架本体 + 官能团对照”,C表把母核、取代体、氧化/还原骨架与常用骨架集中在一起

吲哚、二氢吲哚、1-甲基吲哚、2-甲基吲哚、5-羟基/5-甲氧基吲哚、4-氨基吲哚、2-吲哚酮、靛红、吲哚-2/3-羧酸、吲哚-3-甲醛、7-氮杂吲哚等

需要“特权骨架”做库构建:oxindole/isatin 平台(激酶等项目常见)

表C 母核/取代/氧化衍生物与天然产物

出发点是“骨架平台而不是位点偶联”,C表直接覆盖 oxindole/isatin 这类高频骨架

2-吲哚酮(oxindole)、靛红(isatin)及其对照骨架

有机合成/并行合成:用交叉偶联快速搭建取代吲哚库(Suzuki/炔化/胺化等)

表D 官能化与交叉偶联砌块

这类任务核心是“可偶联手柄(卤代/硼酸)+ 保护策略”,D表专门按偶联入口整理

2/3-溴吲哚、2/3-碘吲哚、4/5/6/7-溴吲哚、5-氟/5-氯/5-硝基吲哚;(1H-吲哚-2-基)硼酸、5-吲哚硼酸;1-Boc-吲哚

位点选择性比较:想系统比较 4/5/6/7 位取代效应(同一反应路线)

表D 官能化与交叉偶联砌块

需要“一套同类型手柄、不同位点”的系列,D表在卤代位点上最齐整便于横向对照

4-溴、5-溴/氯/氟/硝基、6-溴、7-溴等(用于同条件偶联/同条件反应对比)

做N位策略:需要N保护/封闭N–H 来控制反应路径或做对照

表D(保护)+表C(N-取代对照)

保护用于“合成路线控制”,N-取代用于“性质/活性对照”,两表各司其职

1-Boc-吲哚(保护,表D);1-甲基吲哚(封闭N–H对照,表C)

天然产物/生物碱对照:β-咔啉/植物吲哚碱的活性或暴露研究

表C 母核/取代/氧化衍生物与天然产物

这类需求通常是“已有代表分子做对照/机制”,C表收纳天然产物类代表

哈尔碱(β-咔啉)、芦竹碱(植物吲哚生物碱)

染料/显色与材料示例:靛蓝/共轭体系相关讨论或对照

表C 母核/取代/氧化衍生物与天然产物

目标不是合成砌块而是“显色/共轭体系代表”,C表包含靛蓝等材料/染料代表

靛蓝(以及与氧化还原/共轭相关的讨论与对照)

要做“已有药物API/对照品”的质量/杂质/方法学/药理验证

表E 药物API/对照品

如果你的实验是围绕“成药/标准品”展开,优先看E表能最快找到常用对照

吲哚美辛、舒马曲坦、吲哚洛尔、氟伐他汀钠(水合物)

抗炎/COX 抑制相关细胞或酶实验:需要阳性对照

表E 药物API/对照品

需要的是“经典阳性对照”,E表直接给到最常用的吲哚类NSAID

吲哚美辛(NSC-77541)

偏头痛/5-HT1 相关药理与方法学:需要曲坦类对照

表E 药物API/对照品(并可联动表B)

E表提供成药对照;如果同时做5-HT体系背景/通路,可再回看B表的内源性配体

舒马曲坦(E表);5-羟色胺/前体/褪黑素(B表,若需要体系对照)

 

表A|植物生长素/植物相关吲哚(IAA/IBA 及前体/相关物)

 

分类

Cas编号

阿拉丁货号

名称

规格或纯度

产品特色与应用

植物激素/生长素|IAA(组织培养/生长调控)

87-51-4

I101074

3-吲哚乙酸(IAA)

用于植物细胞培养, ≥98%

经典生长素(auxin)标准品:用于植物组织培养(愈伤/生根/伸长)、生长素信号通路与转运机制研究;也常用于生长调节剂活性对照与分析方法开发。

植物激素/生根剂|IBA(生根/插条处理)

133-32-4

I108273

3-吲哚丁酸

≥98%

常用生根剂(生长素类似物):用于扦插生根、组织培养生根诱导与生长调控实验;也常作为IAA的对照(更稳定/作用谱差异)用于植物激素效应比较与配方评估。

植物生长素相关前体/代谢物|IAM(IAA 生物合成支路)

879-37-8

I123331

3-吲哚乙酰胺

≥98%

IAA(3-吲哚乙酸)生物合成/微生物途径常见中间体:用于植物—微生物互作、IAA 代谢通路验证;也常作为“吲哚乙酰胺→酸/腈”转化研究与分析对照标准。

植物生长素相关前体/代谢物|IAN(腈→酸/胺通路)

771-51-7

I107936

3-吲哚乙腈

≥96%

IAA 生物合成/植物防御相关代谢物:常用于“腈→酸/酰胺”转化路径研究、植物代谢与微生物转化机制;也是合成中可水解/还原的功能手柄。

天然产物相关/功能砌块|3-羟甲基吲哚(I3C)

700-06-1

I105220

3-吲哚甲醇

Moligand™, ≥96%

十字花科相关吲哚醇类代表砌块:常用于“膳食吲哚化合物”机制研究(例如信号通路/受体调控等);同时也是3位可进一步官能化的合成起点(缩合、氧化、衍生化)。

 

表B|色氨酸平台与吲哚代谢物(5-HT/褪黑素支路 + 菌群吲哚代谢,生化标准品) 

 

分类

Cas编号

阿拉丁货号

名称

规格或纯度

产品特色与应用

氨基酸/生化平台|色氨酸(细胞培养/代谢前体)

73-22-3

T118579

L-色氨酸

无动物源, USP, JP, Moligand™, 欧洲药典(Ph.Eur), 用于细胞培养, ≥99%

必需氨基酸与生化培养常用品:蛋白/肽研究与细胞培养补充;也是“吲哚胺轴”(色胺/5-羟色胺/褪黑素)与多类吲哚代谢物的关键前体,用于代谢通路与营养调控研究。

氨基酸衍生物/前体|5-HTP(通路研究)

56-69-9

H136196

DL-5-羟基色氨酸

≥99%

5-羟色胺生物合成前体(消旋体):用于色氨酸—5-HT通路的酶学/代谢研究与方法学对照;也常用于建立“前体→产物”转化模型与分析定量。

生物胺/合成砌块|色胺(吲哚乙胺平台)

61-54-1

T101154

色胺

Moligand™, ≥98%

吲哚乙胺(tryptamine)核心砌块:用于合成多类吲哚生物碱/药物先导与受体配体;亦用于神经递质相关研究与衍生化反应底物(N-烷基化、酰化等)。

神经递质/受体配体|5-羟色胺(5-HT)

50-67-9

H303833

5-羟基色胺

Moligand™, ≥98%(HPLC)

典型神经递质(5-HT)标准品:用于5-HT受体/转运体相关药理实验、神经生物学与信号通路研究;也用于生物样品定量方法(LC-MS/MS)建立与校准。

神经内分泌/抗氧化|褪黑素(节律研究)

73-31-4

M118674

褪黑素

Moligand™, ≥98%

典型节律激素:用于睡眠/昼夜节律、抗氧化与免疫调控相关研究;亦常作受体(MT1/MT2)药理实验对照与生物样品检测标准品。

吲哚代谢物/微生物相关|IPA(抗氧化/肠道代谢)

830-96-6

I103959

3-吲哚丙酸(IPA)

Moligand™, ≥98%

色氨酸代谢物代表之一:常用于肠道菌群—宿主代谢、抗氧化/神经保护相关研究;亦可作代谢组学/标准品,用于方法开发与定量校准。

吲哚代谢物/微生物相关|吲哚-3-乳酸(ILA)

1821-52-9

I157602

吲哚-3-乳酸

≥98%(HPLC)

色氨酸代谢物代表:常见于微生物/宿主代谢研究,用于菌群代谢表征、免疫/屏障相关机制探索;亦可作代谢组学标准品与定量参照。

吲哚代谢物/生化中间体|吲哚-3-丙酮酸(I3PA)

392-12-1

I184250

吲哚-3-丙酮酸

≥95%

色氨酸代谢关键中间体:用于酶学与代谢通路研究(转氨/氧化还原相关)、代谢组学标准品与定量;也可作为“α-酮酸手柄”进行衍生化反应研究。

吲哚醇/色氨酸代谢物|色醇(Tryptophol)

526-55-6

T112368

色醇

≥97%(GC)

色氨酸代谢相关吲哚醇:常用于微生物代谢/信号分子研究、代谢组学标准品与 GC 定量;也可作为“吲哚-3-乙醇”官能化起点用于衍生化。

取代吲哚|3-甲基(Skatole,气味/代谢标志物)

83-34-1

S104736

3-甲基吲哚

≥98%

吲哚代谢/风味气味研究常用品(skatole):用于 GC/GC-MS 定量、肠道微生物色氨酸代谢与异味标志物研究;亦可作取代吲哚合成中间体与结构对照。

 

表C|母核/取代/氧化衍生物与天然产物(非卤代偶联类)

 

分类

Cas编号

阿拉丁货号

名称

规格或纯度

产品特色与应用

吲哚母核/基础构件|母核(合成与机理通用)

120-72-9

I104725

吲哚

化学纯(CP), ≥98%

吲哚骨架基础原料:用于Fischer吲哚合成、亲电取代(C3位常见)、N-保护/官能化等通用反应;是多类药物、天然产物与功能材料中间体的起点。

吲哚啉/还原骨架|二氢吲哚(Indoline)

496-15-1

I103557

二氢吲哚

≥99%

还原型吲哚骨架(indoline)通用砌块:用于构建含吲哚啉片段的药物先导与功能分子;也用于比较“芳香吲哚 vs 饱和吲哚啉”对碱性、溶解度与构象的影响。

N-取代吲哚|1-甲基(N位封闭对照)

603-76-9

M108007

1-甲基吲哚

≥97%

N-位甲基化用于“封闭N–H”对照:比较N–H氢键/酸碱性对活性、溶解度与反应路径的影响;也是合成与材料分子中常用的 N-取代吲哚砌块。

取代吲哚构件|2-甲基(气味/合成中间体)

95-20-5

M100903

2-甲基吲哚

≥98%

取代吲哚基础体:用于进一步官能化(侧链引入、氧化/卤代等)与吲哚衍生物库构建;也可用于香精香料/气味相关研究的结构对照(部分甲基吲哚具典型气味特征)。

吲哚母核/官能化构件|5-羟基取代吲哚

1953-54-4

H105520

5-羟基吲哚

Moligand™, ≥98%

常用取代吲哚砌块:用于合成5-羟基吲哚衍生物(神经递质类似物、药物先导、荧光/显色分子等);也可作为氧化/偶联等反应的结构对照底物。

吲哚母核/官能化构件|5-甲氧基取代吲哚

1006-94-6

M111475

5-甲氧基吲哚

≥99%

常用取代吲哚砌块:用于合成褪黑素/5-甲氧基系列衍生物与受体配体;在芳香取代效应(电子给体)对反应活性/光谱性质影响研究中也常作对照底物。

氨基取代吲哚|4-氨基(可进一步酰化/偶联)

5192-23-4

A115486

4-氨基吲哚

≥97%

–NH₂ 是高通量衍生化手柄:用于酰胺化、脲/磺酰胺构建与偶联扩展;适合药物先导结构多样化与构效关系探索。

吲哚酮/骨架砌块|Oxindole(2-吲哚酮)

59-48-3

O100775

2-吲哚酮

≥98%(GC)

“特权骨架”之一(oxindole):在激酶抑制剂等药物化学中非常常见,用于先导合成与结构多样化;也适合用于构效关系与反应方法学(C3位/芳环官能化)探索。

吲哚酮/氧化衍生物|靛红(Isatin)

91-56-5

I104664

靛红(NSC 9262)

AR

吲哚氧化衍生物与“吲哚酮”骨架代表:用于吲哚类氧化/重排机理研究;也是药物化学中常用的杂环骨架中间体(构建多样化取代)。

吲哚酸类|2-羧酸(骨架/配位与成盐手柄)

1477-50-5

I107987

吲哚-2-羧酸

≥98%

羧酸是典型“成盐/偶联手柄”:用于酰胺化、酯化与并环构建;也常用于比较 2-位官能团对吲哚反应性与构象/氢键网络的影响。

吲哚酸类|3-羧酸(C3 官能化代表)

771-50-6

I107990

吲哚-3-羧酸

≥98%

3-位羧酸是C3功能化的代表砌块:常用于酰胺/酯衍生化与构效关系拓展;也可用于建立含吲哚羧酸类的分析方法与对照。

吲哚醛类|3-甲醛(缩合/还原胺化手柄)

487-89-8

I106884

吲哚-3-甲醛

≥97%

常用“C3-醛”砌块:用于还原胺化、Knoevenagel/缩合反应、构建吲哚甲基胺/烯基衍生物;也常用于方法学筛选与建立标准曲线。

含氮同系骨架|7-氮杂吲哚(Azaindole,药化常用骨架)

271-63-6

A124841

7-氮杂吲哚

≥98%

Azaindole 是常见“吲哚替换骨架”:通过引入环内 N 改变碱性、氢键与溶解度/配位特征;常用于激酶抑制剂等药物先导设计与SAR骨架替换。

染料/显色体系|靛蓝(染料/氧化还原相关)

482-89-3

I104182

靛蓝

化学纯(CP), ≥85%

代表性吲哚染料:用于染色/着色研究与材料显色体系;也常作为“氧化还原/共轭体系”示例,用于电化学、光谱与还原染色机理讨论。

天然产物/生物碱|β-咔啉(神经活性研究)

442-51-3

H107067

哈尔碱

Moligand™, ≥98%

β-咔啉类吲哚生物碱代表:用于MAO相关神经药理、食品/烟草中β-咔啉暴露与神经效应研究;也用于天然产物化学与代谢/毒理机理对照。

天然产物/植物防御|吲哚生物碱(Gramine 类)

87-52-5

G107688

芦竹碱

Moligand™, ≥98%

植物来源吲哚生物碱代表:常用于植物化学生态/防御代谢研究;也可作为吲哚胺类结构平台,用于活性筛选与结构修饰(SAR)探索。

非吲哚本体|取代苯乙酮(吲哚合成上游中间体)

455-91-4

F123262

3'-氟-4'-甲氧基苯乙酮

≥98%

取代苯乙酮中间体:常用于构建取代杂环/芳香侧链;在合成路线中可作为Fischer 吲哚等成环反应的上游羰基底物,或用于引入“F + OMe”取代芳香片段以调控疏水性与代谢稳定性。

 

表D|官能化与交叉偶联砌块(卤代/硼酸/保护)

 

分类

Cas编号

阿拉丁货号

名称

规格或纯度

产品特色与应用

卤代吲哚构件|2-卤代(偶联/官能化入口)

139409-34-0

B726304

2-溴-1H-吲哚

≥98%

典型“可偶联”吲哚砌块:2位溴代便于Suzuki、Sonogashira、Buchwald–Hartwig 等交叉偶联与快速搭建取代吲哚库;适合药物发现的并行合成与路线放大评估。

卤代吲哚构件|3-溴代(偶联通用入口)

1484-27-1

B700551

3-溴-1H-吲哚

_

3-位溴代是最常用的吲哚官能化入口之一:用于 Suzuki/胺化/炔化等交叉偶联,快速搭建 C3 取代吲哚衍生物;适合并行合成与工艺条件筛选。

卤代吲哚构件|3-碘代(高活性偶联入口)

26340-47-6

I725702

3-碘代-1H-吲哚

≥98%

3-位碘代便于 Suzuki / Sonogashira / Buchwald 等交叉偶联与快速多样化;适合并行合成吲哚衍生物库、路线筛选与放大前的反应窗口摸底。

卤代吲哚构件|2-碘代(高活性偶联/位点构建)

26340-49-8

I588481

2-碘吲哚

≥95%

2-位碘代反应活性高:用于交叉偶联快速搭建 2-取代吲哚;常见于药物先导与材料分子中“位点精准改造”的关键中间体。

卤代吲哚构件|4-溴代(位点特异官能化)

52488-36-5

B111478

4-溴吲哚

≥98%

4-位卤代是构建“非C3位取代”吲哚的重要起点:用于偶联引入芳基/烯基/炔基或胺化,便于药物先导结构修饰与SAR展开。

卤代吲哚构件|5-氟代(电子效应/代谢稳定性旋钮)

399-52-0

F111474

5-氟吲哚

≥98%

5-F 常用于药物化学“微调旋钮”:评估电子效应、疏水性与代谢稳定性变化;也可作为后续选择性官能化/对照底物。

卤代吲哚构件|5-氯代(常用偶联/对照底物)

17422-32-1

C119122

5-氯吲哚

≥98%

经典卤代吲哚砌块:用于交叉偶联或亲电取代路线对比;在构效关系中常用作“Cl 取代”对照以比较卤素效应与稳定性。

卤代吲哚构件|5-溴代(偶联通用入口)

10075-50-0

B111473

5-溴代吲哚

≥98%

5-Br 兼顾反应活性与可得性:常用于 Suzuki/胺化/炔化等偶联,快速搭建 5-位取代吲哚系列;适合药物/材料分子库构建。

强吸电子取代吲哚|5-硝基(可还原为胺/染料与光谱旋钮)

6146-52-7

N107980

5-硝基吲哚

≥98%

NO₂ 是“强电子效应/可转换手柄”:用于研究取代对反应活性与光谱性质影响;也常先还原成 5-氨基吲哚再做酰化/磺酰化/偶联,扩展衍生物空间。

卤代吲哚构件|6-溴代(区域选择性构建)

52415-29-9

B123498

6-溴吲哚

≥98%

6-位卤代可用于构建“稀少位点取代”的吲哚系列:便于偶联引入多种取代基,用于药物先导/材料分子的结构扫描与位置效应比较。

卤代吲哚构件|7-溴代(位点修饰入口)

51417-51-7

B119150

7-溴吲哚

≥98%

7-位卤代用于构建 7-取代吲哚(偶联/胺化/炔化等),便于位置效应研究与结构多样化;常见于药物化学与功能材料单体修饰。

硼酸构件|吲哚-2-硼酸(Suzuki 偶联)

220396-46-3

B735819

(1H-吲哚-2-基)硼酸

≥95%

Suzuki 偶联核心硼源:用于在 2-位引入芳基/杂芳基等,快速构建 2-取代吲哚库;常用于药物化学并行合成与路线放大可行性评估。

硼酸构件|5-吲哚硼酸(Suzuki 偶联)

144104-59-6

I129077

5-吲哚硼酸

≥95%

5-位硼酸用于 Suzuki 偶联构建 5-取代系列:便于快速引入芳基/杂芳基片段做SAR;也可用于方法学比较(不同位点硼酸的稳定性/偶联条件窗口)。

保护的吲哚母核|N-Boc(选择性反应/控位点)

75400-67-8

B189199

1-Boc-吲哚

≥95%

Boc 保护可降低N位干扰、提升区域选择性:利于进行C3位亲电取代/金属化/偶联等反应;适合多步合成路线中“先保护再官能化”的通用策略。

 

表E|药物API/对照品(吲哚骨架代表药物)

 

分类

Cas编号

阿拉丁货号

名称

规格或纯度

产品特色与应用

药物API/对照品|β受体阻滞剂(含吲哚骨架)

13523-86-9

P275711

吲哚洛尔

Moligand™, ≥99%

含吲哚骨架的β受体阻滞剂类API/对照:用于受体药理、活性/杂质与质量研究;也可用于含吲哚药物的分析方法学与代谢研究对照。

药物API/对照品|NSAID(COX抑制对照)

53-86-1

I106885

吲哚美辛 (NSC-77541)

Moligand™, ≥99%

经典NSAID(COX抑制剂)对照品:用于抗炎/镇痛机制研究、细胞/酶抑制实验阳性对照、药物分析与杂质/降解研究;也常用于方法学验证(HPLC/LC-MS)。

药物API/对照品|曲坦类(5-HT1激动剂)

103628-46-2

S333476

舒马曲坦

Moligand™, ≥98%

经典抗偏头痛药(曲坦类)对照:用于5-HT1受体相关药理与机制研究、API质量/杂质与方法学开发;也用于制剂与溶出行为研究的分析对照。

药物API/对照品|他汀类(HMG-CoA 还原酶抑制剂)

93957-55-2

F129852

氟伐他汀钠 水合物

≥98%

他汀类降脂药对照品:用于 HMG-CoA 还原酶抑制相关机制研究;也常用于 API 质量/杂质与含量测定方法开发(HPLC/LC-MS)及制剂溶出研究。

 

注:以上为阿拉丁代表产品,更多产品规格请关注文末产品清单或可用“品名/CAS/货号”在阿拉丁官网检索。

 

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产品仅供科研与开发使用,不用于人体、动物、诊断或治疗。

引用本文

阿拉丁科学.《吲哚类产品导航:N 位状态、C3 连接口与骨架变体如何映射合成接口与科研用途(表A–E) 》. 阿拉丁知识库,更新于 2026年3月2日。 https://www.aladdin-e.com/zh_cn/faqs/indole-product-navigation.html
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