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别名
1-(β-D-呋喃核糖基)-1,2-二氢嘧啶-2-酮|2-嘧啶酮-1-β- D -核苷|4-脱氧尿苷
概述
Zebularine is a cell-permeable chemically stable cytidine analog and DNA methylation inhibitor which acts by forming a covalent complex with DNMT. It displays antiangiogenic activity and markedly inhibits vessel formation in different tumor models. It reactivates silenced E-cadherin and potentiates the effects of other epigenetic therapeutics such as vorinistat. Induces differentiation of mesenchymal cells into cardiomyocytes. Inhibits cytidine deaminase (CDD). An inhibitor of DNA methyltransferase
规格
别名
1-(β-D-呋喃核糖基)-1,2-二氢嘧啶-2-酮 | 2-嘧啶酮-1-β- D -核苷 | 4-脱氧尿苷
英文别名
PYRIMIDIN-2-ONE .BETA.-D-RIBOFURANOSIDE | 1-beta-D-Ribofuranosyl-2(1H)-pyrimidino ne | 1-Pentofuranosylpyrimidin-2(1H)-one | 1-((2R,3R,4S,5R)-3,4-Dihydroxy-5-Hydroxymethyl-Tetrahydro-Furan-2-yl)-1H-Pyrimidin-2-one | 4-(Ethoxycarbonyl)cyclohexene-1-boronic acid pinacol ester | 1-beta-D-ribofuranosyl-2(1H)-pyrimidinone | 1-beta-D-ribofurano 展开
规格或纯度
Moligand™, ≥98%(HPLC)
生化机理
Zebularine是一种胞苷类似物、胞苷脱氨酶抑制剂和DNA去甲基化剂,是DNA甲基转移酶(DNMT)抑制剂和胞苷脱氨酶抑制剂(K i = 2 µM)。在体外和体内抑制肿瘤生长。
应用
An inhibitor of DNA methyltransferase
备注
如果有可能,您尽量在使用的当天配置溶液,并在当天使用完它。但是,如果您需要预先配制储备溶液,我们建议您将溶液等份保存在-20°C的密封小瓶中。通常,它们最多可以使用一个月。在使用前和打开样品瓶之前,我们建议您让您的产品在室温下平衡至少1小时。需要更多关于溶解度,用法和处理的建议吗?请访问我们的常见问题(FAQ)页面以获取更多详细信息。
名称和识别符
IUPAC Name
1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidin-2-one
INCHI
1S/C9H12N2O5/c12-4-5-6(13)7(14)8(16-5)11-3-1-2-10-9(11)15/h1-3,5-8,12-14H,4H2/t5-,6-,7-,8-/m1/s1
InChi Key
RPQZTTQVRYEKCR-WCTZXXKLSA-N
Smiles
C1=CN(C(=O)N=C1)C2C(C(C(O2)CO)O)O
Isomeric SMILES
C1=CN(C(=O)N=C1)[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)CO)O)O
高级数据
系统学分类
界(kingdom)
有机化合物
超类(Superclass)
核苷、核苷酸及其类似物
类(Class)
嘧啶核苷
亚类(Subclass)
暂无
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes)
暂无
直接上位类(Direct Parent)
嘧啶核苷
其他上位类(Alternative Parents)
糖胺 戊糖 嘧啶酮类 氢化嘧啶 四氢呋喃 杂芳族化合物 仲醇 氧环化合物 氮杂环化合物 伯醇 有机光子化合物 有机氮化合物 有机氧化物 碳氢化合物衍生物
分子骨架(Molecular Framework)
芳香族杂单环化合物
取代基(Substituents)
羟基苯甲酸酯 - 芳香族杂单环化合物 - 氮杂环 - 糖基化合物 - 杂芳香族化合物 - 烃衍生物 - 羟吡啶 - 单糖 - N-羧酰胺基-α-氨基酸或其衍生物 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机杂环化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 氧杂环 - 五碳单糖 - 初级醇 - 嘧啶 - 嘧啶核苷 - 嘧啶酮 - 醛基 - 四氢呋喃
描述(Description)
该化合物属于嘧啶核苷类有机化合物。这类化合物由嘧啶碱基与核糖基或脱氧核糖基相连构成。
外部描述符(External Descriptors)
pyrimidine ribonucleosides
三维结构
关联靶点(人)
关联靶点(其它种属)
作用机制
作用机制
Action Type
target ID
Target Name
Target Type
Target Organism
Binding Site Name
参考文献
化学和物理性质
溶解性
Soluble in DMSO (>25 mg/ml), methanol (5 mg/ml), water (>25 mg/ml), DMF (~5 mg/ml), and ethanol (~0.25 mg/ml).
比旋光度
+156.0 ~ +160.0°(C=1, MeOH)
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
3
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
5
可旋转键计数Rotatable Bond Count
2
精确质量Exact Mass
228.075 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
228.075 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
103.000 Ų
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
4
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
技术文档和文章
此产品的引用文献
溶液计算器
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