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Oxyma 偶联体系的实验判断:偶联效率、消旋控制与 DIC 体系的 HCN 风险

导读
 
        在酰胺键形成中,Oxyma〔乙基 2-氰基-2-(羟亚胺基)乙酸酯,常见商品名为 OxymaPure〕通常被归为降低消旋的偶联添加剂。这个定义只覆盖了它的一部分作用。2009 年的代表性研究已将 Oxyma 明确为 HOBt〔1-羟基苯并三唑〕、HOAt〔1-羟基-7-氮杂苯并三唑〕的替代型添加剂,讨论重点不仅包括偶联效率和抑制消旋,也涉及苯并三唑类添加剂的安全性问题。
 
        此后,Oxyma 的实验意义进一步集中到几类更具体的判断上:在羧酸活化过程中,能否在提高偶联效率的同时保持立体化学稳定;在固相合成中,能否减轻部分碱驱动副反应;在酸敏固相载体,尤其是 2-氯三苯甲基树脂条件下,是否比常见含羟基添加剂更适配;以及在 DIC〔N,N′-二异丙基碳二亚胺〕参与的体系中,如何处理与氢氰酸生成相关的问题。
 
Oxyma 的实验判断通常要围绕四个方面展开:偶联效率是否不足,光学纯度是否下降,碱敏副反应是否放大,以及当前体系是否已经受到 DIC/Oxyma 相关副反应和氢氰酸问题的限制。不同问题,对应的试剂组合、碳二亚胺选择和溶剂安排并不相同。
 
1. Oxyma 相关实验问题的分层
 
        Oxyma 体系中的实验判断,通常要分开看四类问题:一是羧酸活化与偶联效率,二是手性中心保持,三是碱驱动副反应与酸敏固相载体相容性,四是 DIC 参与条件下的氢氰酸生成。不同类别,对应的试剂选择、介质安排和比较顺序并不相同。
 
1.1|Oxyma 体系中需要分开判断的几类实验问题
 
实验问题
常见表现
判断重点
优先比较方向
偶联效率不足
偶联不完全、位阻较大底物转化慢、片段拼接困难
先看 Oxyma 是否能同时改善转化率与粗品纯度
Oxyma/碳二亚胺 与独立缩合剂平行比较
消旋控制不足
光学纯度下降、困难氨基酸或片段偶联时消旋放大
重点不只是收率,而是手性保持是否改善
Oxyma、本体衍生物与高活性缩合剂比较
碱驱动副反应明显
反复脱保护后杂质积累、序列纯度下降、酸敏固相载体稳定性变差
需要分清问题来自脱保护步骤、偶联阶段碱用量,还是树脂本身耐受性
比较脱保护碱、缚酸碱、Oxyma 形态及固相载体条件
DIC 条件受限
使用 DIC/DMF 时存在放大、长时间停留或多轮循环
重点是 DIC/Oxyma 组合是否仍应保留,以及介质是否需要调整
比较不同碳二亚胺,并比较 DMF、NBP、NBP/乙酸乙酯等介质
 
2. 不同 Oxyma 衍生体系对应的实验任务
 
        Oxyma 各衍生体系对应的实验任务并不相同。COMU 为 Oxyma 型脲鎓独立缩合剂;PyOxP、PyOxB、PyOxim 等为 Oxyma 型膦鎓缩合剂;K-Oxyma 尤其适用于酸敏固相载体条件,特别是 2-氯三苯甲基树脂相关偶联;含甘油缩酮骨架的 Oxyma 衍生物主要用于水相或高含水条件下的低消旋偶联;Oxyma-B、Oxyma-T 则主要用于更高要求的消旋控制比较。
 
2.1|不同 Oxyma 体系的主要使用场景与实验时优先确认项
 
体系
主要使用场景
代表性特征
实验时优先确认
Oxyma + 碳二亚胺
常规偶联的起始筛选
经典添加剂路线,常用于比较偶联效率、消旋控制和副反应情况
碳二亚胺类型、是否采用 DIC、溶剂组成、试剂配比与活化后停留时间
COMU
需要独立缩合剂完成活化的偶联
Oxyma 型脲鎓缩合剂,可将活化体与离去基整合到同一试剂中
底物位阻、粗品纯度、后处理便利性,以及与 HATU、HBTU 等独立缩合剂的差别
PyOxP / PyOxB
困难偶联、位阻较大底物、环化类偶联
Oxyma 型膦鎓缩合剂,在困难模型中表现出较强活化能力和较低消旋倾向
困难底物转化率、环化效率、粗品纯度,以及与脲鎓型试剂的差别
K-Oxyma
酸敏固相载体条件,尤其是 2-氯三苯甲基树脂相关偶联
Oxyma 的钾盐形式,消除了游离 Oxyma 的酸性负担,同时保留促酰化能力
树脂稳定性、装载后肽链脱落情况、偶联效率,以及是否需要额外有机碱配合
含甘油缩酮骨架的 Oxyma 衍生物
水相或高含水条件下的低消旋酰胺键形成
可与 EDC·HCl、碳酸氢钠配合,在水中实现低消旋偶联
水相溶解性、碱体系匹配、底物在水中的稳定性,以及后处理方式
Oxyma-B
对光学纯度要求更高的偶联
在多个模型中,对消旋的抑制优于 OxymaPure 及相关苯并三唑体系
光学纯度是否明显改善,以及这种改善是否伴随收率或反应速度变化
Oxyma-T
需要进一步比较消旋控制的场景
在逐步溶液相模型中,Oxyma-T 的消旋低于 HOBt、HOAt、OxymaPure 和 Oxyma-B
逐步偶联与片段偶联应分开评估,分别比较消旋水平和转化率
 
3. DIC/Oxyma 体系中的氢氰酸生成与条件选择
 
在 DIC/Oxyma 体系中,HCN 生成是已被证实的副反应,判断重点应放在碳二亚胺类型、溶剂组成、试剂配比和活化后停留时间。
 
1) HCN 生成不是偶发杂质,而是 DIC/Oxyma 体系中已被实验证实的副反应。2019 年的过程化学研究表明,在 DMF 中、20 °C 条件下,Oxyma 与 DIC 在氨基酸活化过程中会生成 HCN;当 Oxyma 和 DIC 相对底物过量时,氨基酸活化完成后 HCN 仍可继续累积。
 
2) HCN 的生成与累积都会受到多项条件变量影响。
需要单独确认的变量包括碳二亚胺类型、溶剂组成、试剂配比,以及活化后的停留时间。这些因素都会影响 HCN 的生成速率和累积水平,只是影响方式并不相同。
 
3) 在 DIC/Oxyma 条件下,溶剂变化会同时影响 HCN 生成和偶联速率。
2020 年研究指出,在其考察的羧酸/Oxyma/DIC = 1:1:1 条件下,HCN 生成速率按 DMF > NBP > NBP/乙酸乙酯(1:1) > NBP/乙酸乙酯(1:4) 的顺序下降;酰胺键形成速率则按 DMF≈NBP < NBP/乙酸乙酯(1:1) < NBP/乙酸乙酯(1:4) 的顺序提高。
 
4) DIC/Oxyma 体系的比较重点不应只落在 Oxyma 本身。
是否继续保留 DIC,是否继续使用 DMF,试剂是否过量,以及活化液是否存在无效停留时间,都是需要单独比较的条件项。
 
5) 替代碳二亚胺已不只是设想,是已有文献支持的比较方向。
2021 年研究表明,TBEC 和 EDC·HCl 与 OxymaPure 的反应不生成 HCN,因此可作为 DIC/Oxyma 的替代比较方向。
 
3.1|DIC/Oxyma 体系中优先确认的实验变量
 
实验情形
需要确认的变量
优先比较项目
DIC/Oxyma/DMF 作为常规偶联条件
是否必须同时保留 DIC 与 DMF
DIC/DMF 与 DIC/NBP、DIC/NBP/乙酸乙酯(1:1)、DIC/NBP/乙酸乙酯(1:4) 的差别
试剂存在过量,且活化后有等待时间
Oxyma、DIC 的过量幅度;活化后停留时间
先压缩 Oxyma、DIC 用量,再比较不同预活化或静置时间对氢氰酸累积的影响
既要控制氢氰酸,又要保持偶联效率
溶剂变化对 HCN 生成速率和酰胺键形成速率的共同影响
比较 DMF、NBP、NBP/乙酸乙酯(1:1)、NBP/乙酸乙酯(1:4)
已进入放大、自动化或连续批次运行
活化液配制后的驻留时间;设备或管路中的停留时间;废液与挥发物处理方式
先比较现有工艺中活化液从配制到使用的实际停留时间,再决定是否需要同步更换碳二亚胺和溶剂
准备重做整套偶联条件
当前限制是否已来自 DIC/Oxyma 本身
比较 DIC/Oxyma 与 TBEC/Oxyma、EDC·HCl/Oxyma 的差别
 
4. Oxyma 偶联体系产品导航表(按科研或实验目标选表1–表4)
 
科研或实验目标
建议先看哪张表
为什么先看这张表
建议联动看哪张表
联动原因
想先分清 Oxyma 体系里哪些是游离添加剂,哪些是钾盐型或强化抑制消旋衍生物,哪些已经属于独立缩合剂
表1
表1按添加剂、衍生添加剂和独立缩合剂分开,便于先分清各试剂承担的实验任务
表2
再与 HOBt、HOAt 及其对应缩合剂对照,判断当前替换的是添加剂层面,还是整套活化方式
想比较 Oxyma 路线与三唑型体系在偶联效率、抑制消旋和试剂选择上的差别
表2
表2集中列出 HOBt、HOAt 及对应脲鎓、膦鎓试剂,便于先建立外部参照
表1、表3
表1用于对应 Oxyma 类添加剂与独立缩合剂,表3用于判断差别是否还与碳二亚胺选择有关
想从“添加剂配合碳二亚胺”起步筛选常规偶联条件,再决定是否改用独立缩合剂
表1
先分清应比较 Oxyma、K-Oxyma 还是强化抑制消旋衍生物,避免一开始把添加剂路线与独立缩合剂路线混在一起
表3
再比较 DCC、DIC、EDC·HCl、TBEC 等碳二亚胺,判断差别是否主要来自活化剂
想重点评估 DIC 配合 Oxyma 时的氢氰酸问题,或比较不同碳二亚胺的差别
表3
表3直接对应几类碳二亚胺,便于先看清问题主要来自哪一类活化剂
表4、表1
表4可继续比较溶剂、碱和固相条件对该问题的影响,表1则用于判断是否改走独立缩合剂路线
想围绕溶剂替换、绿色介质和树脂适配调整条件
表4
表4把溶剂、碱和树脂放在一起,便于直接比较介质变化对偶联和副反应的影响
表3
更换介质后,往往还要同步判断是否需要调整碳二亚胺
想研究碱敏副反应,特别是脱保护碱、缚酸碱与偶联条件之间的配套关系
表4
表4直接对应哌啶、二异丙基乙胺、碳酸氢钠及常用介质,便于先分清问题主要来自哪一步
表1
再判断是继续调整碱和介质,还是改用另一类 Oxyma 试剂或独立缩合剂
想在酸敏固相载体上比较 Oxyma、钾盐型肟添加剂与高活性体系的兼容性
表4
表4中的 2-氯三苯甲基树脂是判断固相适配性的直接起点
表1、表2
表1可比较 Oxyma 体系内部差别,表2可加入三唑型高活性体系作参照
想做困难偶联、位阻较大底物或高光学纯度要求的条件筛选
表1
表1集中列出 Oxyma-B、COMU、PyOxim 等更适合高要求偶联任务的试剂
表2、表4
表2可加入 HATU、PyAOP 等外部对照,表4可继续检查当前瓶颈是否还与溶剂、碱或固相载体有关
想从小试走向放大,同时兼顾效率、纯度、后处理和氢氰酸问题
表3
活化剂选择会直接影响副产物类型、后处理方式和氢氰酸生成倾向
表1、表4
表1可比较是否改用独立缩合剂以简化体系,表4可补充溶剂、碱和树脂对实际操作的影响
 
表1|Oxyma 核心添加剂、抑制消旋衍生物与 Oxyma 型独立缩合剂
 
分类
Cas编号
阿拉丁货号
名称
规格或纯度
产品特色与应用
核心肟型偶联添加剂
3849-21-6
2-肟氰乙酸乙酯
≥98%
Oxyma 本体,常与 DIC、DCC、EDC·HCl 等配合用于羧酸活化,适合建立偶联效率、抑制消旋能力和副反应情况的基础对照。
钾盐型肟添加剂
158014-03-0
K-Oxyma
≥97%
适合与游离 Oxyma 平行比较,尤其适用于 2-氯三苯甲基树脂等酸敏固相条件下考察树脂稳定性、酰化效率和长时间接触后的表现。
强化抑制消旋型肟添加剂
5417-13-0
5-hydroxyimino-1,3-dimethyl-hexahydropyrimidine-2,4,6-trione
≥97%
适合易消旋片段、困难氨基酸或高光学纯度要求的偶联筛选,用于比较其与 Oxyma 在抑制消旋方面的差别。
Oxyma 衍生缩合试剂
1426821-11-5
Boc-Oxyma
≥98%
可直接用于羧酸活化,适合与“游离添加剂加碳二亚胺”路线平行比较活化方式、计量设置和后处理差别,也可用于酰胺、酯和硫酯形成相关比较。
Oxyma 型脲鎓缩合剂
1075198-30-9
COMU
≥98%
常用于液相和固相酰胺键形成,适合与 HATU、HBTU 或 DIC/Oxyma 体系比较活化效率、抑制消旋能力和后处理便利性。
Oxyma 型脲鎓缩合剂
136849-72-4
O-[(乙氧羰基)氰基亚甲基氨基]-N,N,N',N'-四甲基脲四氟硼酸盐
≥98%
适合与 TBTU、COMU 对照,比较四氟硼酸盐型脲鎓试剂在液相或固相中的活化效率、底物适应性和副反应情况。
Oxyma 型膦鎓缩合剂
153433-21-7
氰基(羟基亚氨基)醋酸乙酯基-O2]三-1-吡咯烷基六氟磷酸盐
≥98%
适合位阻较大底物、环化或其他较困难偶联,与脲鎓型 Oxyma 试剂比较活化强度、反应干净程度和抑制消旋表现。
 
表2|三唑型添加剂与对应独立缩合剂对照
 
分类
Cas编号
阿拉丁货号
名称
规格或纯度
产品特色与应用
经典三唑型添加剂
2592-95-2
1-羟基苯并三唑(HOBT)
≥99%
经典偶联添加剂,适合与 Oxyma 类添加剂比较羧酸活化效率、抑制消旋能力和副反应差别。
高活性三唑型添加剂
39968-33-7
1-羟基-7-氮杂苯并三唑(HOAt)
≥99%
活性高于 HOBt,适合与 Oxyma、强化抑制消旋型肟添加剂平行比较在困难偶联和高光学纯度要求下的表现。
HOAt 型脲鎓缩合剂
148893-10-1
O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N′,N′-四甲基脲六氟磷酸酯(HATU)
≥99%
高活性独立缩合剂,适合与 COMU、PyOxim 对照,用于位阻较大底物和困难偶联的条件筛选。
HOBt 型脲鎓缩合剂
94790-37-1
苯并三氮唑-N,N,N',N'-四甲基脲六氟磷酸酯(HBTU)
≥99%
常规多肽偶联常用缩合剂,适合作为 Oxyma 型独立缩合剂的基础参照。
HOBt 型四氟硼酸盐脲鎓缩合剂
125700-67-6
O-苯并三氮唑-N,N,N',N'-四甲基脲四氟硼酸酯
≥98%
适合与 TOTU 对照,比较两类四氟硼酸盐型脲鎓缩合剂在活化效率和后处理方面的差别。
HOBt 型膦鎓缩合剂
128625-52-5
1H-苯并三唑-1-基氧三吡咯烷基鏻六氟磷酸盐
≥98%
经典膦鎓型缩合剂,适合与 PyOxim 或脲鎓型试剂比较在困难偶联、环化和较慢底物上的表现。
HOAt 型膦鎓缩合剂
156311-83-0
六氟磷酸(7-氮杂苯并三唑-1-氧基)三吡咯烷磷
≥97%
高活性膦鎓型试剂,适合与 HATU、PyOxim 并行比较,用于更高活化要求的偶联任务。
 
表3|碳二亚胺活化剂与氢氰酸风险相关对照
 
分类
Cas编号
阿拉丁货号
名称
规格或纯度
产品特色与应用
经典碳二亚胺活化剂
538-75-0
N,N'-二环己基碳二亚胺(DCC)
≥99%
经典羧酸活化剂,适合与 Oxyma、HOBt、HOAt 配合建立碳二亚胺偶联基线,并比较副产物去除和反应清洁度。
DIC 型碳二亚胺活化剂
693-13-0
N,N′-二异丙基碳二亚胺(DIC)
≥98.5%
与 Oxyma 组合常用于液相和固相偶联,也是评估氧二唑副产物、氢氰酸生成倾向、加料顺序和停留时间影响的关键对照。
水溶性碳二亚胺活化剂
25952-53-8
1-乙基-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺盐酸盐
≥98%
适合溶液相、含水条件或便于水洗后处理的羧酸活化,也可与 Oxyma 或其钾盐组合,比较其与 DIC、DCC 在活化方式和后处理上的差别。
TBEC 型碳二亚胺活化剂
1433-27-8
1-叔丁基-3-乙基碳二亚胺
≥98%
可与 Oxyma 配合考察相较 DIC 更低的氢氰酸生成倾向,并比较其在绿色介质和放大条件下的偶联表现。
 
表4|介质、碱与固相载体相关组分
 
分类
Cas编号
阿拉丁货号
名称
规格或纯度
产品特色与应用
温和无机碱
144-55-8
碳酸氢钠
无水级, 试剂级, 高级纯, ≥99.5%
适合在含水或较温和条件下调节酸碱度,可用于比较弱碱条件对活化效率、底物耐受性和副反应的影响。
常用极性酰胺溶剂
68-12-2
N,N-二甲基甲酰胺(DMF)
无水级, ≥99.8%
是 Oxyma/碳二亚胺体系和固相多肽合成的常用介质,也是比较 DIC/Oxyma 组合中氢氰酸生成倾向的重要参照溶剂。
脱保护用有机碱
110-89-4
哌啶(易制毒)
生物技术级,≥99.5%
常用于 Fmoc 去保护,也常用来放大天冬酰亚胺等碱敏副反应的差别,便于比较偶联体系与脱保护步骤之间的相互影响。
常用缚酸有机碱
7087-68-5
N,N-二异丙基乙胺
精馏级, ≥99.5%
常与独立缩合剂或羧酸活化体系配套,用于调节酰化速率并比较碱用量对消旋和副反应的影响。
绿色混合溶剂组分
141-78-6
乙酸乙酯
GR, ≥99.5%
常与 1-丁基-2-吡咯烷酮等配伍,用于替代部分 DMF,并比较介质变化对偶联效率、树脂溶胀和氢氰酸生成倾向的影响。
绿色极性溶剂
3470-98-2
1-丁基-2-吡咯烷酮
≥98%(GC)
可作为 DMF 替代介质,与乙酸乙酯形成混合溶剂,适合比较固相偶联效率、树脂适配性和后处理便利性。
酸敏固相载体
934816-82-7
2-氯三苯甲基树脂
100-200 mesh,1% DVB,0.4-3.0mmol/g
常用于酸敏肽链装载和固相偶联,适合比较 Oxyma、K-Oxyma 及高活性缩合剂在固相条件下对树脂稳定性和偶联效果的影响。
 
注:以上为阿拉丁代表产品,更多产品规格可用‘品名/CAS/货号’在阿拉丁官网检索。
 
参考文献
 
[1] Subirós-Funosas R, Prohens R, Barbas R, El-Faham A, Albericio F. Oxyma: An efficient additive for peptide synthesis to replace the benzotriazole-based HOBt and HOAt with a lower risk of explosion. Chem. Eur. J. 2009;15(37):9394-9403. doi:10.1002/chem.200900614.
 
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[3] Subirós-Funosas R, El-Faham A, Albericio F. PyOxP and PyOxB: The Oxyma-based novel family of phosphonium salts. Org. Biomol. Chem. 2010;8(16):3665-3673. doi:10.1039/C003719B.
 
[4] Subirós-Funosas R, El-Faham A, Albericio F. Use of Oxyma as pH modulatory agent to be used in the prevention of base-driven side reactions and its effect on 2-chlorotrityl chloride resin. Biopolymers. 2012;98(2):89-97. doi:10.1002/bip.21713.
 
[5] Wang Q, Wang Y, Kurosu M. A new Oxyma derivative for nonracemizable amide-forming reactions in water. Org. Lett. 2012;14(13):3372-3375. doi:10.1021/ol3013556.
 
[6] Cherkupally P, Acosta GA, Nieto-Rodriguez L, Spengler J, Rodriguez H, Khattab SN, El-Faham A, Shamis M, Luxembourg Y, Prohens R, Subirós-Funosas R, Albericio F. K-Oxyma: A strong acylation-promoting, 2-CTC resin-friendly coupling additive. Eur. J. Org. Chem. 2013;(28):6372-6378. doi:10.1002/ejoc.201300777.
 
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[12] Fantoni T, Orlandin A, Di Stefano I, Macis M, Tolomelli A, Ricci A, Cabri W, Ferrazzano L. Solid phase peptide synthesis using side-chain unprotected arginine and histidine with Oxyma Pure/TBEC in green solvents. Green Chem. 2024;26:10929-10939. doi:10.1039/D4GC03209H.
 
[13] Manne SR, Luna O, Acosta GA, Royo M, El-Faham A, Orosz G, de la Torre BG, Albericio F. Amide formation: Choosing the safer carbodiimide in combination with OxymaPure to avoid HCN release. Org. Lett. 2021;23(17):6900-6904. doi:10.1021/acs.orglett.1c02466.
 
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引用本文

阿拉丁科学.《Oxyma 偶联体系的实验判断:偶联效率、消旋控制与 DIC 体系的 HCN 风险》. 阿拉丁知识库,更新于 2026年4月22日。 https://www.aladdin-e.com/zh_cn/faqs/experimental-judgment-in-oxyma-coupling-systems.html
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