L2319323计算溶液所需的质量、体积或浓度。
| 活性类型 | Relation | Activity value | Units | Action Type | 期刊 | PubMed Id | doi | Assay Aladdin ID |
|---|
为什么选择此级别
提供 ≥95% 纯度，适用于对基线干扰要求严格的色谱和分析工作流程。
储存与运输
-20°C储存。超低温运输 。请查阅批次 COA 获取详细规格。
质量文档
SDS、COA、产品数据表及规格说明书均可下载。可通过批号查询获取批次 COA。
文献证明
在色谱分析、有机合成和交叉偶联反应领域已被 0 篇同行评审文献引用。
概述
5-Hydroxymethyl-2’-deoxycytidine (5hmdC) 是 DNA 中 5-methyl-2'-deoxycytidine (5-mdC) 的氧化衍生物。5-Hydroxymethyl-2’-deoxycytidine 可能作为细胞不可逆转损伤的标志物。
Product description：
5-Hydroxymethyl-2’-deoxycytidine (5hmdC) is an oxidation derivative of 5-methyl-2'-deoxycytidine (5-mdC) in DNA. 5-Hydroxymethyl-2’-deoxycytidine may serve as a marker of irreversibly damaged cells.
规格
别名
2'-脱氧-5-(羟甲基)胞苷
英文别名
Cytidine, 2'-deoxy-5-(hydroxymethyl)- | HY-131394 | 2'-deoxy-5-(hydroxymethyl)cytidine | 4-Amino-1-(4-hydroxy-5-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-5-hydroxymethyl-1H-pyrimidin-2-one | 5-Hydroxymethyldeoxycytidine monophosphate | PD017712 | 4-Amino-1-((2
规格或纯度
≥95%
英文名称
5-(Hydroxymethyl)-2'-deoxycytidine
生化机理
能够在双链DNA中产生链间交联的修饰的嘧啶。用于定量生物样品中的DNA羟甲基化水平。
储存条件
-20°C储存
运输条件
超低温运输
备注
如果有可能，您尽量在使用的当天配置溶液，并在当天使用完它。但是，如果您需要预先配制储备溶液，我们建议您将溶液等份保存在-20°C的密封小瓶中。通常，它们最多可以使用一个月。在使用前和打开样品瓶之前，我们建议您让您的产品在室温下平衡至少1小时。需要更多关于溶解度，用法和处理的建议吗？请访问我们的常见问题（FAQ）页面以获取更多详细信息。
纯度
≥95%
名称和识别符
PubChem SID
分子类型
小分子
IUPAC Name
4-amino-1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-(hydroxymethyl)pyrimidin-2-one
INCHI
1S/C10H15N3O5/c11-9-5(3-14)2-13(10(17)12-9)8-1-6(16)7(4-15)18-8/h2,6-8,14-16H,1,3-4H2,(H2,11,12,17)/t6-,7+,8+/m0/s1
InChi Key
HMUOMFLFUUHUPE-XLPZGREQSA-N
Smiles
C1C(C(OC1N2C=C(C(=NC2=O)N)CO)CO)O
Isomeric SMILES
C1[C@@H]([C@H](O[C@H]1N2C=C(C(=NC2=O)N)CO)CO)O
分子量
257.25
Reaxy-Rn
62050958
Reaxys-RN link address
https://www.reaxys.com/reaxys/secured/hopinto.do?context=S&query=IDE.XRN=62050958&ln=
技术文档
高级数据
系统学分类
分类树（Taxonomy Tree）
-
界（kingdom)
有机化合物
-
超类（Superclass)
核苷、核苷酸及其类似物
-
类（Class)
嘧啶核苷
- 亚类（Subclass） 嘧啶2'-脱氧核糖核苷
-
类（Class)
嘧啶核苷
-
超类（Superclass)
核苷、核苷酸及其类似物
| 界（kingdom) | 有机化合物 |
|---|---|
| 超类（Superclass) | 核苷、核苷酸及其类似物 |
| 类（Class) | 嘧啶核苷 |
| 亚类（Subclass） | 嘧啶2'-脱氧核糖核苷 |
| 中间层级节点（Intermediate Tree Nodes） | 暂无 |
| 直接上位类(Direct Parent) | 嘧啶2'-脱氧核糖核苷 |
| 其他上位类（Alternative Parents） | 嘧啶酮类 氨基嘧啶及其衍生物 咪唑内酰胺类 氢化嘧啶 四氢呋喃 杂芳族化合物 仲醇 氧环化合物 氮杂环化合物 伯胺 伯醇 有机光子化合物 有机氧化物 碳氢化合物衍生物 芳香醇 |
| 分子骨架（Molecular Framework) | 芳香族杂单环化合物 |
| 取代基（Substituents） | 羟基苯甲酸酯 - 氨基酸 - 氨基吡啶 - 芳香醇 - 芳香族杂单环化合物 - 氮杂环 - 杂芳香族化合物 - 烃衍生物 - 羟吡啶 - 咪唑内酰胺 - 有机硝基化合物 - 有机氧化物 - 有机氧化合物 - 有机杂环化合物 - 有机氮化合物 - 有机氧化合物 - 有机氮化合物 - 氧杂环 - 初级醇 - 初级胺 - 嘧啶 - 嘧啶-2'-脱氧核糖核苷 - 嘧啶酮 - 醛基 - 四氢呋喃 |
| 描述（Description） | 该化合物属于嘧啶2'-脱氧核糖核苷类有机化合物。这类化合物由嘧啶与核糖连接而成，其核糖分子2位缺乏羟基。 |
| 外部描述符（External Descriptors） | 暂无 |
三维结构
交互式化学结构模型
关联靶点（人）
CEM-SS
(2428 活性数据)
关联靶点（其它种属）
Human immunodeficiency virus 1 (70413 活性数据)
作用机制
| 作用机制 | Action Type | target ID | Target Name | Target Type | Target Organism | Binding Site Name | 参考文献 |
|---|
化学和物理性质
熔点
205 °C
分子量
257.240 g/mol
XLogP3
-2.100
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
4
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
5
可旋转键计数Rotatable Bond Count
3
精确质量Exact Mass
257.101 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
257.101 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
129.000 Ų
重原子数Heavy Atom Count
18
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
408.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
3
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书（CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
技术文档和文章
溶液计算器
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