合成琼脂糖

CAS: 9012-36-6 货号: S579058 EC号: 232-731-8 PubChem CID: 11966311
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级别和纯度: 低电内渗,高强度
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文献证明

在色谱分析、有机合成和交叉偶联反应领域已被 266 篇同行评审文献引用。

概述

Aladdin合成琼脂糖系列产品采用合成技术,摆脱天然海藻原料的依赖性,以获得更高的凝胶强度、更低的电内渗(EEO)和更高的分辨率。


本产品拥有极低的电内渗(EEO=0.03),使得 DNA的电泳迁移率显著高于传统琼脂糖凝胶,减少条带扩散的影响,提高电泳分辨率,非常适合通过凝胶电泳和印迹法对核酸进行常规快速分析。


本产品具备超高胶强(≥2000g/cm2),制备凝胶不易破损,可支持长时间的脉冲场凝胶电泳。


本产品不含 DNase、RNase 和 Protease,可形成低染色背景、高强度的凝胶,批间稳定性高度一致。


产品信息:

产品名称

规格

货号

合成琼脂糖

低电内渗、高强度

S579058-25g

合成琼脂糖 

低电内渗、高强度 

S579058-100g

合成琼脂糖 

低电内渗、高强度 

S579058-500g


基础参数:

化学式

C₁₂H₁₈O₉

外观

白色/微黄色粉末

凝胶强度(g/cm2)

≥2000(1.%)

凝胶温度(℃)

36.0±2℃(1.5%)

熔胶温度(℃)

87.0±2℃(1.5%)

电渗率(-mr)

0.03

硫酸盐含量 (%)

≤0.1

DNase、RNase、 Protease 含量

未检出


使用方法:

脉冲场凝胶电泳胶块制备: 

1. 取组织淹没过滤,细胞计数。

2. 将细胞与琼脂糖混合后加入凝胶膜具中,待凝固后取出。

3. 用含有蛋白酶 K 的裂解液将胶块内的细胞裂解,释放出 DNA。

4. 用苯甲基磺酰胺(PMSF)去除蛋白酶 K。

5. 可储存于 0.5MEDTA 中。


注意事项:

1. 本产品仅限科学研究使用,不得用于临床诊断和治疗等领域。

2. 通过微波炉加热溶解琼脂糖时,请始终佩戴护目镜,保护自己和他人免受烫伤。


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产品名称

货号

低熔点琼脂糖

S579062

高分辨率琼脂糖

S579073

高电内渗琼脂糖

S579082

超低凝胶温度琼脂糖

S579091


产品列表

用途产品名称规格凝胶强度  (g/cm²)点内渗          (-mr)凝胶温度      (1.5% grl)溶胶温度      (1.5% grl)货号包装
常规核酸电泳,Southern
Blo, Northern Blot,
PFGE
合成琼脂糖低电内渗≥1700(1.5% gel)≤0.0336℃±2℃87℃±2℃S57905025g/100g/500g
合成琼脂糖低电内渗、高强度≥2000(1% gel)≤0.0336℃±2℃87℃±2℃S579058
*对标Lonza Seakem°Gold Agarose,强度≥1800(1% gel),电内渗≤0.05,凝胶温度36℃±1.5℃,熔胶温度>90°℃
核酸片段回收,胶内反应,组织培养细胞克隆,病毒空斑实验合成琼脂糖低熔点≥260(1% gel)≤0.0630±2℃≤65℃S57906225g/100g/500g
*对标Lonza SeaPlaqueTMAgarose,强度200(1%gel),电内渗≤0.1,凝胶温度26℃-30℃,熔胶温度≤65℃
小片段核酸、PCR产物等
分离纯化
合成琼脂糖高分辨率≥300(1% gel)≤0.05≤35℃(3% gel)≤75℃(3% gel)S57907325g/100g/500g
*对标Lonza MetaPhorTMAgarose,强度≥200(1% gel)[实测],电内渗≤0.05,凝胶温度≤35℃(3% gel),熔胶温度≤75℃(3% gel)
IEP,CIEP,crossed-IEP,
血清蛋白电泳
合成琼脂糖高电内渗≥1700(1.5% gel)0.2536℃±2℃87℃±2℃S57908225g/100g/500g
*对标Lonza SeaKem°HEAgarose,强度≥1500(1.5%gel),电内渗0.23-0.26,凝胶温度34.5℃-37.5℃,熔胶温度>90℃
CDNAlibraries合成琼脂糖超低凝胶温度≥75(2% gel)≤0.0314±1℃≤45℃S57909125g/100g/500g
*对标Lonza SeaPrepAgarose,强度≥75(2% gel),电内渗≤0.05,凝胶温度8℃-17℃(0.8%gel),熔胶温度≤50(1% gel)


规格

英文别名
AKOS015916622 | MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N | Agarose gel beads | Agarose | EINECS 232-731-8 | agarotetraose | CHEBI:2511 | [4)-3,6-An-alpha-L-Galp-(1->3)-beta-D-Galp-(1->]n | SCHEMBL1413225 | (2S,3R,4S,5R,6R)-2-[[(1S,3S,4S,5S,8R)-3-[(2S,3R,4S,5S,6R)-2-[[
规格或纯度
低电内渗,高强度
英文名称
Synthetic agarose
储存条件
室温
运输条件
常规运输
名称和识别符
PubChem SID
EC号
232-731-8
分子类型
生物试剂/缓冲液
IUPAC Name
(2S,3R,4S,5R,6R)-2-[[(1S,3S,4S,5S,8R)-3-[(2S,3R,4S,5S,6R)-2-[[(1S,3R,4S,5S,8R)-3,4-dihydroxy-2,6-dioxabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]oxy]-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-4-hydroxy-2,6-dioxabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]oxy]-6-(hydroxymethyl)oxane-3,4,5-triol
INCHI
1S/C24H38O19/c25-1-5-9(27)11(29)12(30)22(38-5)41-17-8-4-36-20(17)15(33)24(40-8)43-18-10(28)6(2-26)39-23(14(18)32)42-16-7-3-35-19(16)13(31)21(34)37-7/h5-34H,1-4H2/t5-,6-,7+,8+,9+,10+,11+,12-,13+,14-,15+,16-,17-,18+,19+,20+,21-,22+,23+,24+/m1/s1
InChi Key
MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N
Smiles
C1[C@H]2[C@H]([C@@H](O1)[C@@H]([C@@H](O2)O)O)O[C@H]3[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O3)CO)O)O[C@H]4[C@H]([C@H]5[C@@H]([C@@H](O4)CO5)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O6)CO)O)O)O)O)O
Isomeric SMILES
C1[C@H]2[C@H]([C@@H](O1)[C@@H]([C@@H](O2)O)O)O[C@H]3[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O3)CO)O)O[C@H]4[C@H]([C@H]5[C@@H]([C@@H](O4)CO5)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O6)CO)O)O)O)O)O
关联CAS
PubChem CID

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高级数据

系统学分类

分类树(Taxonomy Tree)

界(kingdom) 有机化合物
超类(Superclass) 有机氧化合物
类(Class) 有机氧化合物
亚类(Subclass) 碳水化合物和碳水化合物结合物
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) 暂无
直接上位类(Direct Parent) 寡糖
其他上位类(Alternative Parents) O-糖基化合物  1,4-二氧杂环庚烷  氧烷  氧杂环戊烷  仲醇  半缩醛  多元醇  氧环化合物  二烷基醚  缩醛  伯醇  碳氢化合物衍生物  
分子骨架(Molecular Framework) 脂肪族杂多环化合物
取代基(Substituents) 1,4-二氧杂环戊烷 - 乙醛酸 - 羟基苯甲酸酯 - 脂肪族杂多环化合物 - 二烷基醚 - 二氧杂环戊烷 - 乙醚 - 糖基化合物 - 半缩醛 - 烃衍生物 - O-羧基化合物 - 萜类化合物 - 有机杂环化合物 - 氧杂环 - 氧杂环丁烷 - 氧杂环丁烷 - 多醇 - 初级醇 - 醛基
描述(Description) 该化合物属于有机化合物中的寡糖类。这类碳水化合物由3至10个单糖单元通过糖苷键相互连接而成。
外部描述符(External Descriptors) 暂无
三维结构
交互式化学结构模型





化学和物理性质
熔点
62-68℃
分子量
630.500 g/mol
XLogP3
-6.500
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
10
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
19
可旋转键计数Rotatable Bond Count
8
精确质量Exact Mass
630.201 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
630.201 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
285.000 Ų
重原子数Heavy Atom Count
43
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
946.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
20
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
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批号(Lot Number) 证书类型 货号
H2301414 分析证书 S579058
H2301419 分析证书 S579058
H2301423 分析证书 S579058
H2301657 分析证书 S579058
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