高纯度琼脂糖

CAS: 9012-36-6 货号: A397944 EC号: 232-731-8 PubChem CID: 11966311
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文献证明

在色谱分析、有机合成和交叉偶联反应领域已被 266 篇同行评审文献引用。

概述

产品简介

琼脂糖作为凝胶电泳常用支持物,其纯度会直接影响 DNA 的分 辨能力及电泳结果的清晰度。Agarose 为高纯度的琼脂糖,通常配置成浓度为 0.5 ~ 2% 的琼脂糖凝胶,用于分离、鉴定核酸,如 DNA 鉴定、 DNA 限制性内切核酸酶图谱制作等。加入核酸荧光染料,使用凝胶成像扫描仪,即可观察电泳结束后的核酸条带。


质量控制

凝胶强度(1% 凝胶):> 1200 g/cm2 ;

电渗(EEO):< 0.15; 硫化物:≤ 0.15%;

凝胶温度(1.5% 凝胶):35~37℃;

熔胶温度(1.5% 凝胶):87~89℃;

水分:≤ 10%;

核酸酶不得检出。


使用方法

1. 依据目的核酸片段大小及电泳缓冲液类型,确定所需琼脂糖浓度


2. 琼脂糖凝胶制备(以水平电泳琼脂糖凝胶制备为例):

① 根据制胶量及凝胶浓度,量取一定量的电泳缓冲液(TAE 或 TBE),倒入三角锥形瓶中。

注:制胶缓冲液和电泳缓冲液需一致。

② 准确称量琼脂糖,小心加入上述三角锥形瓶中。在锥形瓶的瓶口盖上牛皮纸,置于微波炉中加热溶解。加热至溶液沸腾后,请戴上防热手套,小心晃动锥形瓶,如此重复数次,直至琼脂糖完全溶解。

注:琼脂糖溶解过程采用多次短暂沸腾的方法 , 避免溶液过热暴沸。保证琼脂糖充分完全溶解,以免造成电泳图像模糊不清。

③ 在充分溶解的琼脂糖里加入核酸染料 。

④ 将琼脂糖溶液倒入制胶模中,然后在适当位置处插上梳子。凝胶厚度一般在 3~5 mm 之间。

⑤ 室温下待胶凝固(大约 30 分钟 ~1 小时),置于电泳槽中进行电泳。


注意事项

1. 熔胶可能会引起暴沸,需注意防止烫伤。

2. 若使用具有致癌性的荧光染料进行凝胶核酸染色 ( 如溴化乙锭等 ), 请佩戴手套。

3. 配置好的凝胶如不立即使用,请将凝胶泡于电泳缓冲液(TAE 或者 TBE 中)备用,避免凝胶干胶。


规格

英文别名
AG
英文名称
Agarose
储存条件
室温
运输条件
常规运输
名称和识别符
PubChem SID
EC号
232-731-8
分子类型
低聚糖
IUPAC Name
(2S,3R,4S,5R,6R)-2-[[(1S,3S,4S,5S,8R)-3-[(2S,3R,4S,5S,6R)-2-[[(1S,3R,4S,5S,8R)-3,4-dihydroxy-2,6-dioxabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]oxy]-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-4-hydroxy-2,6-dioxabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]oxy]-6-(hydroxymethyl)oxane-3,4,5-triol
INCHI
1S/C24H38O19/c25-1-5-9(27)11(29)12(30)22(38-5)41-17-8-4-36-20(17)15(33)24(40-8)43-18-10(28)6(2-26)39-23(14(18)32)42-16-7-3-35-19(16)13(31)21(34)37-7/h5-34H,1-4H2/t5-,6-,7+,8+,9+,10+,11+,12-,13+,14-,15+,16-,17-,18+,19+,20+,21-,22+,23+,24+/m1/s1
InChi Key
MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N
Smiles
C1[C@H]2[C@H]([C@@H](O1)[C@@H]([C@@H](O2)O)O)O[C@H]3[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O3)CO)O)O[C@H]4[C@H]([C@H]5[C@@H]([C@@H](O4)CO5)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O6)CO)O)O)O)O)O
Isomeric SMILES
C1[C@H]2[C@H]([C@@H](O1)[C@@H]([C@@H](O2)O)O)O[C@H]3[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O3)CO)O)O[C@H]4[C@H]([C@H]5[C@@H]([C@@H](O4)CO5)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O6)CO)O)O)O)O)O
关联CAS
PubChem CID

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系统学分类

分类树(Taxonomy Tree)

界(kingdom) 有机化合物
超类(Superclass) 有机氧化合物
类(Class) 有机氧化合物
亚类(Subclass) 碳水化合物和碳水化合物结合物
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) 暂无
直接上位类(Direct Parent) 寡糖
其他上位类(Alternative Parents) O-糖基化合物  1,4-二氧杂环庚烷  氧烷  氧杂环戊烷  仲醇  半缩醛  多元醇  氧环化合物  二烷基醚  缩醛  伯醇  碳氢化合物衍生物  
分子骨架(Molecular Framework) 脂肪族杂多环化合物
取代基(Substituents) 1,4-二氧杂环戊烷 - 乙醛酸 - 羟基苯甲酸酯 - 脂肪族杂多环化合物 - 二烷基醚 - 二氧杂环戊烷 - 乙醚 - 糖基化合物 - 半缩醛 - 烃衍生物 - O-羧基化合物 - 萜类化合物 - 有机杂环化合物 - 氧杂环 - 氧杂环丁烷 - 氧杂环丁烷 - 多醇 - 初级醇 - 醛基
描述(Description) 该化合物属于有机化合物中的寡糖类。这类碳水化合物由3至10个单糖单元通过糖苷键相互连接而成。
外部描述符(External Descriptors) 暂无
三维结构
交互式化学结构模型





化学和物理性质
熔点
62-68℃
分子量
630.500 g/mol
XLogP3
-6.500
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
10
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
19
可旋转键计数Rotatable Bond Count
8
精确质量Exact Mass
630.201 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
630.201 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
285.000 Ų
重原子数Heavy Atom Count
43
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
946.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
20
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
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批号(Lot Number) 证书类型 货号
H2612272 分析证书 A397944
H2612273 分析证书 A397944
D2313905 分析证书 A397944
D2313945 分析证书 A397944
I2524114 分析证书 A397944
I2524165 分析证书 A397944
C2514126 分析证书 A397944
C2514128 分析证书 A397944
F2418301 分析证书 A397944
F2418302 分析证书 A397944
D2313903 分析证书 A397944
D2313940 分析证书 A397944
F2223090 分析证书 A397944
F2223446 分析证书 A397944
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