琼脂糖

CAS: 9012-36-6 货号: A434532 EC号: 232-731-8 PubChem CID: 11966311
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级别和纯度: 分子生物学级 ? 适用于分子生物学 —— 不含降解 DNA/RNA 的核酸酶和污染物。适用于克隆、PCR 和需要洁净试剂的核酸工作。 超低凝胶温度
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文献证明

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概述

琼脂糖是从琼脂或含琼脂海藻中提取的聚合物。这一纯化的线性半乳聚糖水胶体由交替的共聚物D-半乳糖和3,6-脱水-L-半乳糖单元通过α-(1→3)和-β(1→4)糖苷键连接组成。琼脂糖具有出色的生物相容性,并具有可变的机械和扩散特性。琼脂糖可用作胶凝剂,电泳分离核酸。


应用

琼脂糖用于: 奇异果甜蛋白和弹性蛋白酶蛋白结晶 使用带有微通道的聚二甲基硅氧烷(PDMS)模具进行微铸造 琼脂糖微约束阵列 超低凝胶温度凝琼脂糖可以产生高强度的凝胶。非常适合用于对热不稳定样品电泳以及杂交瘤或其他细胞系生长。

Agarose is a polymer extracted from agar or agar-bearing marine algae. This purified linear galactan hydrocolloid comprises alternating co-polymers D-galactose and 3,6-anhydro-L-galactose units connected by α-(1→3) and β-(1→4) glycosidic bonds. Agarose is highly biocompatible and possesses variable mechanical and diffusion properties. Agarose can be used as a gelling agent, to separate nucleic acids electrophoretically.


Application

Agarose has been used: in thaumatin and elastase protein crystallization in microcasting using a polydimethylsiloxane (PDMS) mold with micro-channel in agarose micro-confinement array Yields unusually strong gels for an ultra-low gelling agarose. Ideal for electrophoresis of heat-labile samples and for growth of hybridomas or other cell lines.

规格

英文别名
AKOS015916622 | MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N | CHEBI:2511 | [4)-3,6-An-alpha-L-Galp-(1->3)-beta-D-Galp-(1->]n | SCHEMBL1413225 | (1->4)-3,6-anhydro-alpha-L-galactopyranosyl-(1->3)-beta-D-galactopyranan | 2-[[3-[2-[(3,4-dihydroxy-2,6-dioxabicyclo[3.2.1]octa
规格或纯度
分子生物学级, 超低凝胶温度
英文名称
Agarose
储存条件
室温
名称和识别符
EC号
232-731-8
分子类型
生物试剂/缓冲液
IUPAC Name
(2S,3R,4S,5R,6R)-2-[[(1S,3S,4S,5S,8R)-3-[(2S,3R,4S,5S,6R)-2-[[(1S,3R,4S,5S,8R)-3,4-dihydroxy-2,6-dioxabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]oxy]-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-4-hydroxy-2,6-dioxabicyclo[3.2.1]octan-8-yl]oxy]-6-(hydroxymethyl)oxane-3,4,5-triol
INCHI
1S/C24H38O19/c25-1-5-9(27)11(29)12(30)22(38-5)41-17-8-4-36-20(17)15(33)24(40-8)43-18-10(28)6(2-26)39-23(14(18)32)42-16-7-3-35-19(16)13(31)21(34)37-7/h5-34H,1-4H2/t5-,6-,7+,8+,9+,10+,11+,12-,13+,14-,15+,16-,17-,18+,19+,20+,21-,22+,23+,24+/m1/s1
InChi Key
MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N
Smiles
C1[C@H]2[C@H]([C@@H](O1)[C@@H]([C@@H](O2)O)O)O[C@H]3[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O3)CO)O)O[C@H]4[C@H]([C@H]5[C@@H]([C@@H](O4)CO5)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O6)CO)O)O)O)O)O
Isomeric SMILES
C1[C@H]2[C@H]([C@@H](O1)[C@@H]([C@@H](O2)O)O)O[C@H]3[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O3)CO)O)O[C@H]4[C@H]([C@H]5[C@@H]([C@@H](O4)CO5)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O6)CO)O)O)O)O)O
关联CAS
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系统学分类

分类树(Taxonomy Tree)

界(kingdom) 有机化合物
超类(Superclass) 有机氧化合物
类(Class) 有机氧化合物
亚类(Subclass) 碳水化合物和碳水化合物结合物
中间层级节点(Intermediate Tree Nodes) 暂无
直接上位类(Direct Parent) 寡糖
其他上位类(Alternative Parents) O-糖基化合物  1,4-二氧杂环庚烷  氧烷  氧杂环戊烷  仲醇  半缩醛  多元醇  氧环化合物  二烷基醚  缩醛  伯醇  碳氢化合物衍生物  
分子骨架(Molecular Framework) 脂肪族杂多环化合物
取代基(Substituents) 1,4-二氧杂环戊烷 - 乙醛酸 - 羟基苯甲酸酯 - 脂肪族杂多环化合物 - 二烷基醚 - 二氧杂环戊烷 - 乙醚 - 糖基化合物 - 半缩醛 - 烃衍生物 - O-羧基化合物 - 萜类化合物 - 有机杂环化合物 - 氧杂环 - 氧杂环丁烷 - 氧杂环丁烷 - 多醇 - 初级醇 - 醛基
描述(Description) 该化合物属于有机化合物中的寡糖类。这类碳水化合物由3至10个单糖单元通过糖苷键相互连接而成。
外部描述符(External Descriptors) 暂无
三维结构
交互式化学结构模型





化学和物理性质
熔点
62-68℃
分子量
630.500 g/mol
XLogP3
-6.500
氢键供体数Hydrogen Bond Donor Count
10
氢键受体数Hydrogen Bond Acceptor Count
19
可旋转键计数Rotatable Bond Count
8
精确质量Exact Mass
630.201 Da
单同位素质量Monoisotopic Mass
630.201 Da
拓扑极表面积Topological Polar Surface Area
285.000 Ų
重原子数Heavy Atom Count
43
形式电荷Formal Charge
0
复杂度Complexity
946.000
同位素原子数Isotope Atom Count
0
定义的原子立体中心计数Defined Atom Stereocenter Count
20
未定义的原子立体中心计数Undefined Atom Stereocenter Count
0
定义的键立体中心计数Defined Bond Stereocenter Count
0
未定义的键立体中心计数Undefined Bond Stereocenter Count
0
所有立体化学键的总数The total count of all stereochemical bonds
0
共价键合单元计数Covalently-Bonded Unit Count
1
质检证书(CoA,COO,BSE/TSE 和分析图谱)
C of A & Other Certificates(BSE/TSE, COO):
输入批号以搜索分析图谱:
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