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细胞凋亡检测中的TUNEL标记与结果判读

        TUNEL法是细胞凋亡检测中最常用的DNA断裂标记方法之一。该方法的检测对象是DNA链断裂末端的3'-OH位点,而不是凋亡通路本身。因此,TUNEL结果的解释不能停留在“有无阳性”,而应建立在核定位、形态学背景、样本处理质量和对照体系完整性的基础上。对组织切片、细胞爬片和悬浮细胞而言,TUNEL都可以提供有价值的断裂信息;但若将DNA断裂直接等同于凋亡,则结果外推极易偏离实验本意。

 

        关键词:TUNEL标记;细胞凋亡;DNA断裂;TdT;组织切片;结果判读

 

1 TUNEL标记的检测对象与方法边界

1.1 反应基础

        TUNEL反应的核心是末端脱氧核糖核苷酸转移酶(TdT)将标记核苷酸加到DNA断裂末端的3'-OH位点上,使原本不可见的DNA断裂转化为荧光或显色信号。凋亡过程中常伴随核DNA片段化,因此TUNEL可用于识别发生凋亡相关DNA断裂的细胞群体。

 

1.2 信号来源

        TUNEL阳性并不只出现在经典凋亡中。凡是能形成较多DNA断裂末端的过程,理论上都可能产生阳性信号,包括:

(1)凋亡相关核酸内切酶切割。

(2)严重DNA损伤后的断裂积累。

(3)坏死或继发性坏死导致的核完整性破坏。

(4)组织处理不当造成的人工性DNA损伤。

(5)过度蛋白酶消化、过强透化或切片损伤导致的核暴露异常。

 

1.3 结果解释的边界

        TUNEL阳性可支持“该区域存在DNA断裂增加”,但不能单独推出以下结论:

(1)该细胞一定处于经典程序性凋亡。

(2)该样本的死亡方式一定以凋亡为主。

(3)凋亡通路一定为caspase依赖型。

(4)阳性面积越大,凋亡生物学意义越明确。

        真正可用于机制判断的结果,需要与cleaved caspase-3、PARP裂解、BAX/BCL-2变化、Annexin V、线粒体膜电位、HE形态或时间梯度结果联合解读。

 

2 样本类型与前处理差异

2.1 石蜡切片

        石蜡切片是TUNEL应用最常见的样本类型。其优势在于组织结构完整、空间定位明确、便于分析特定解剖区域中的凋亡分布。其主要干扰因素包括固定时间、脱蜡质量、蛋白酶处理强度和坏死背景。

        石蜡样本中更需关注以下环节:

(1)固定过度导致TdT进入和末端暴露不足。

(2)脱蜡不充分导致试剂渗透不均。

(3)蛋白酶消化过强导致核边界破坏和假阳性升高。

(4)坏死区过大导致凋亡与坏死信号混杂。

 

2.2 冰冻切片

        冰冻切片中DNA保存速度快,部分样本中TUNEL信号更灵敏,但组织完整性通常弱于石蜡切片。若切片保存、复温或固定控制不当,核结构更易受损,背景也更易升高。

        冰冻样本中应重点控制:

(1)切片厚度与完整性。

(2)固定时间是否适中。

(3)切片干燥过程是否引起核损伤。

(4)是否存在冻融伪影或边缘断裂。

 

2.3 细胞爬片与悬浮细胞

        在细胞模型中,TUNEL常用于药物诱导、氧化应激、放疗/化疗损伤及基因操作后的凋亡检测。该类样本的关键变量包括细胞密度、固定方式、透化强度和细胞状态同步性。

        细胞样本中常见偏差包括:

(1)细胞过密导致核重叠。

(2)透化过强导致全核高背景。

(3)悬浮细胞离心和洗涤过程造成机械损伤。

(4)取样时间点偏早或偏晚,导致DNA断裂窗口与实验目的不一致。


表1 不同样本类型中TUNEL检测的重点差异

 

样本类型

优势

主要风险

判读重点

石蜡切片

组织结构完整,定位清楚

固定、脱蜡、消化条件影响大

阳性细胞空间分布、组织学对应关系

冰冻切片

DNA保存较快,反应灵敏

结构脆弱,背景易升高

核完整性、边缘伪影、裂隙信号

细胞爬片

单细胞分辨率高

透化和固定偏差直接影响结果

单细胞核信号、阳性比例

悬浮细胞

适合批量检测或流式联用

洗涤与离心损伤干扰大

群体阳性率、细胞碎片干扰

 

3 实验流程中的关键控制点

3.1 固定与透化

        TUNEL实验首先受固定与透化控制。固定不足时,细胞结构不稳定;固定过强时,TdT进入核内和断裂末端暴露受限。透化不足时标记反应不充分,透化过强时会增加非特异信号。

        结果出现普遍弱阳性而组织完整时,应优先考虑渗透不足;若出现满片弥散核染或胞浆污染,则更应考虑透化或消化过强。

 

3.2 蛋白酶处理

        蛋白酶K等消化步骤常用于改善试剂进入,但也是TUNEL假阳性的重要来源。消化不足时反应偏弱;消化过强时核边界破坏、DNA暴露异常、局部组织松解,均可导致非生理性阳性增加。

        蛋白酶处理应与样本类型联动判断:

(1)长期固定石蜡切片可适度加强。

(2)脆弱组织、坏死组织和冰冻切片应降低强度。

(3)细胞爬片通常不需要与厚组织同等级别的消化。

(4)不同组织间不宜机械套用同一处理时间。

 

3.3 阳性对照与阴性对照

        TUNEL实验必须保留完整对照。

        阴性对照通常省略TdT酶或关键标记步骤,用于判断体系背景。阴性对照若仍出现大面积核阳性,说明背景控制失败。

        阳性对照通常通过DNase I预处理产生可检测的DNA断裂末端,用于验证体系是否可正常反应。阳性对照无信号时,不能直接将实验样本判为“无凋亡”。

 

3.4 读出方式

        TUNEL既可采用荧光法,也可采用DAB等显色法。荧光法更适合与DAPI、Hoechst或细胞类型标记联合使用,便于单细胞定位分析;显色法更适合石蜡切片和常规组织病理观察。

        不同读出方式对应不同判读重点:

(1)荧光法重点在核内共定位、单细胞分辨率和通道背景。

(2)显色法重点在组织结构、阳性细胞形态和区域分布。

(3)过曝光或过显色均会人为扩大阳性范围。

(4)图像采集参数必须在组间保持一致。

 

4 TUNEL结果判读的核心标准

4.1 阳性定位

        TUNEL的主要判读对象是细胞核。具有解释价值的阳性通常表现为核内局灶或较强信号,与DAPI或Hoechst核定位一致。若信号主要位于胞浆、细胞外碎片、坏死渗出物或切片裂隙中,则不宜直接判作凋亡阳性。

        核定位判读时应重点关注:

(1)阳性信号是否严格位于核区。

(2)阳性核形态是否与固缩、碎裂或边缘浓缩一致。

(3)阳性信号是否集中于特定细胞群。

(4)阳性区域是否与明显坏死灶重叠。

 

4.2 阳性强度与阳性率

        TUNEL结果不能只看颜色深浅,更重要的是阳性率和阳性细胞分布模式。单个细胞强阳性并不必然比大片中等阳性更有解释价值。若阳性信号集中于特定处理组并具有稳定分布规律,即使信号中等,也具有较高判断价值。

        量化中常见指标包括:

(1)TUNEL阳性细胞数 / 总细胞数。

(2)TUNEL阳性面积 / 目标组织面积。

        前者更适合细胞实验和细胞边界清楚的组织;后者更适合坏死背景多、细胞边界不清或组织水平比较。

 

4.3 组织分布模式

        TUNEL判读不能脱离组织学背景。凋亡常表现为散在或局灶性核阳性;若整个坏死区呈大片弥散阳性,多提示坏死或严重DNA破坏,而非单纯凋亡增加。对肿瘤、缺血损伤、神经组织和炎症组织,空间分布往往比单纯阳性总量更重要。


表2 TUNEL阳性信号的判读框架

 

判读维度

支持凋亡解释的表现

需谨慎处理的表现

定位

核内信号明确,与核染重合

胞浆、细胞外、裂隙或坏死区弥散信号

形态

核固缩、核碎裂、局灶阳性

结构崩解、大片无边界强阳性

分布

散在、成群或处理相关区域性增加

全片随机升高或边缘伪影集中

对照

阴性对照低背景,阳性对照反应正常

阴性对照本身偏高或阳性对照失败

一致性

与HE形态、凋亡标记一致

与坏死、机械损伤或处理伪影重叠

 

5 常见误判来源与结果陷阱

5.1 将DNA断裂直接等同于凋亡

        这是TUNEL最常见的解释错误。TUNEL检测到的是DNA断裂末端,而不是凋亡通路本身。DNA损伤、坏死、组织损伤和处理伪影均可产生阳性。

 

5.2 坏死区误判

        坏死区域往往含大量断裂DNA和核碎片,常出现大面积高强度信号。若不结合HE或组织形态,极易将坏死信号误判为“凋亡显著增加”。

 

5.3 边缘伪影误判

        切片边缘、折叠区、刀痕区和脱片边界处更易出现人工性高背景。这类信号若在各组均出现且集中于边缘,通常不应纳入统计。

 

5.4 过度量化

        TUNEL常被机械处理为“阳性越多,凋亡越强”。这一表述并不严谨。不同组织、不同时间点和不同损伤模型中,TUNEL升高可能对应早期凋亡增强、晚期继发性坏死或损伤扩展,含义并不一致。

 

6 TUNEL与其他指标的联合判读

6.1 与形态学结合

        HE染色、DAPI/Hoechst核染和超微结构观察是TUNEL结果解释的重要基础。若TUNEL阳性与核固缩、核碎裂、凋亡小体形成一致,则结果解释更稳固。

 

6.2 与凋亡通路标记结合

        TUNEL与cleaved caspase-3、cleaved PARP、BAX/BCL-2、cytochrome c释放等指标联合时,更容易建立“DNA断裂—凋亡通路激活”之间的证据链。若TUNEL阳性升高,而caspase依赖指标无变化,则需考虑非典型死亡方式或处理伪影。

 

6.3 与时间梯度结合

        凋亡检测中,时间点比单一终点更重要。取样过早时,TUNEL可能尚未明显升高;取样过晚时,凋亡细胞可能已被清除或进入继发性坏死。建立时间梯度后,TUNEL结果更易与损伤、修复或处理效应对应。


表3 TUNEL联合判读的常见组合

 

联合指标

主要用途

判读价值

HE形态

区分凋亡与坏死背景

提供组织学基础

DAPI/Hoechst

明确核定位与核形态

提高单细胞判读准确性

Cleaved caspase-3

验证凋亡通路活化

提高机制解释力度

Annexin V

补充早期凋亡信息

弥补TUNEL时间窗限制

Ki-67/增殖标记

结合增殖-凋亡平衡分析

提高组织动态解释能力

 

 

7 不同实验场景中的判读重点

7.1 细胞实验

        细胞模型中,TUNEL判读重点在于单细胞核信号、阳性率和处理时间依赖性。结果描述宜使用“阳性细胞比例增加”“核内断裂信号增强”等表述。

 

7.2 组织损伤模型

        缺血再灌注、炎症损伤、神经退行性模型和药物毒性模型中,TUNEL常与坏死、炎症细胞浸润并存。此类样本判读重点应放在阳性细胞所属区域、细胞类型及与坏死区的空间关系。

 

7.3 肿瘤研究

        肿瘤样本中的TUNEL既可反映治疗诱导凋亡,也可能与肿瘤中心坏死、治疗后DNA损伤和微环境缺氧相关。肿瘤研究中,TUNEL判读应结合坏死区识别、肿瘤边缘区/中心区分层和增殖指标共同完成。

 

8 实验结果的表述方式

8.1 适合写入结果部分的表述

        结果描述宜围绕“定位、比例、分布、组间差异”展开,例如:

(1)处理组TUNEL阳性细胞比例升高,信号主要位于核内。

(2)阳性细胞集中分布于损伤边缘区,而非大片坏死中心。

(3)联合DAPI染色可见阳性细胞伴核固缩和碎裂。

(4)阴性对照背景低,阳性对照反应充分,检测体系稳定。

 

8.2 不宜直接写入结果部分的表述

        以下表述外推过度,宜避免直接使用:

(1)TUNEL阳性说明细胞一定发生经典凋亡。

(2)TUNEL升高证明某通路已被激活。

(3)阳性面积增大即可说明处理效果更强。

(4)弱阳性减少即可说明保护作用已确立。

 

9 TUNEL检测相关产品

9.1 TUNEL检测基础试剂表

 

名称

CAS号

实验环节

关键用途

使用要点

蛋白酶K

39450-01-6

样本前处理

改善组织或细胞核内DNA末端暴露,提高TdT反应可及性

处理过强易造成核边界破坏和假阳性升高

DNase I

9003-98-9

阳性对照制备

人工产生DNA断裂末端,用于验证TUNEL体系是否正常工作

仅用于阳性对照,不参与正式实验组判读

过氧化氢

7722-84-1

显色前封闭

在DAB显色体系中用于内源性过氧化物酶封闭,降低组织背景

主要用于HRP-DAB型TUNEL读出

二氨基联苯胺(DAB)

7411-49-6

显色检测

用于HRP体系下的棕褐色显色,便于石蜡切片组织定位观察

显色时间过长易扩大阳性范围

Triton X-100

9002-93-1

透化处理

提高TdT和标记核苷酸进入细胞核的效率

透化过强可导致全核高背景或核结构受损

柠檬酸钠

6132-04-3

缓冲液配制

可用于部分前处理或核酸酶反应缓冲环境建立

作为方法学配套缓冲组分使用

甲醛

50-00-0

固定

用于细胞或组织固定,保持核结构和样本形态

固定不足和固定过度均会影响TUNEL结果

Hoechst 33342

23491-52-3

核复染

用于荧光TUNEL中的核定位与阳性信号共定位判断

适合观察核固缩、核碎裂等形态变化

碘化丙啶(PI)

25535-16-4

核复染/损伤辅助判读

用于部分荧光体系中的核染与细胞死亡状态辅助判断

需注意与坏死细胞高染背景的区分

甘油

56-81-5

封片

用于部分荧光封片体系配制,维持成像稳定性

长时保存时宜结合抗淬灭体系使用

 

9.2 TUNEL检测配套产品表

 

产品类型

货号

名称

级别和纯度

适用研究方向/用途

核心酶

T1425044

末端脱氧核糖核苷酸转移酶

—

TUNEL核心反应酶,用于将标记dUTP加到DNA断裂末端

核心酶

T751007

末端脱氧核糖核酸转移酶 (TdT)

EnzymoPure™,生物活性,ActiBioPure™,无菌,无DNA酶和RNA酶,5.0 U/μL

适合常规TUNEL末端标记反应

核心酶

T751008

末端脱氧核糖核酸转移酶 (TdT)

ActiBioPure™,生物活性,EnzymoPure™,无菌,无DNA酶和RNA酶,20 U/μL

适合批量样本处理或高活性TdT体系

核心酶

T1492047

末端脱氧核糖核酸转移酶 (TdT, 20U/μL)

ActiBioPure™,生物活性,EnzymoPure™,无DNA酶和RNA酶,20 U/μL

适合组织切片或细胞样本的高活性末端标记反应

标记底物

B598295

Biotin-dUTP(生物素-dUTP)

—

适合生物素型TUNEL标记体系,用于后续链霉亲和素或HRP放大检测

标记底物

B598358

Biotin TUNEL细胞凋亡试剂盒

—

适合生物素法TUNEL检测,用于组织切片显色或放大检测流程

标记底物

B1454858

Biotin-11-dUTP trisodium

≥99%

适合构建生物素型TdT末端标记体系

标记底物

B658667

Biotin-16-dUTP trisodium

≥97%

适合构建生物素延伸链更长的TUNEL标记体系

标记底物

S1451224

Sulfo-Cy3-E-dUTP

—

适合橙红通道荧光TUNEL检测

标记底物

S598307

Sulfo-Cy3-E-dUTP(磺酸基-Cy3-乙基-dUTP)

—

适合Cy3通道TUNEL荧光标记

标记底物

S1452014

Sulfo-Cy5 dUTP

—

适合远红通道TUNEL标记

标记底物

S1450285

Sulfo-Cy5.5 dUTP

—

适合更长波长荧光TUNEL检测

标记底物

T1427888

Tetramethylrhodamine-dUTP

—

适合罗丹明通道TUNEL标记

标记底物

V1451234

Vari Fluor 488-dUTP

≥99%

适合绿色荧光TUNEL标记

标记底物

V1452507

Vari Fluor 555-dUTP

—

适合橙红通道TUNEL检测

标记底物

V1454207

Vari Fluor 594-dUTP

—

适合红色通道TUNEL标记

标记底物

V1453078

Vari Fluor 640-dUTP

≥98%

适合远红荧光TUNEL检测

试剂盒

T1456509

TUNEL细胞凋亡检测试剂盒(显色法)

BioReagent,比色法,用于显微镜

适合石蜡组织切片或常规明场TUNEL判读

试剂盒

A598363

aladdin®488 TUNEL细胞凋亡试剂盒(绿色荧光)

—

适合绿色荧光TUNEL检测

试剂盒

A598361

aladdin®555 TUNEL细胞凋亡试剂盒(橙红色荧光)

—

适合橙红通道TUNEL检测

试剂盒

A598362

aladdin®594 TUNEL细胞凋亡试剂盒(红色荧光)

—

适合红色通道TUNEL检测

试剂盒

A598360

aladdin®640 TUNEL细胞凋亡试剂盒(远红荧光)

—

适合远红通道TUNEL检测

封片与成像

A752105

增强型荧光淬灭封片剂

BioReagent,适用于荧光分析,适用于免疫荧光(IF)

适合荧光TUNEL成像后封片,降低淬灭

封片与成像

F598330

抗荧光淬灭剂

—

适合荧光TUNEL终点封片

封片与成像

A598329

抗荧光淬灭封片剂

—

适合荧光TUNEL切片长期保存和观察

封片与成像

A752104

抗荧光淬灭封片液

—

适合荧光TUNEL样本封片

封片与成像

A1209180

抗荧光淬灭封片液(含DAPI)

BioReagent,适用于免疫荧光(IF),适用于免疫组织化学(for IHC)

适合荧光TUNEL后直接完成封片与核复染

封片与成像

A1209484

抗荧光淬灭封片液(含Hoechst 33342和PI)

BioReagent,适用于免疫组织化学(for IHC),适用于免疫荧光(IF)

适合荧光TUNEL与核形态、PI信号联合观察

封片与成像

A1209301

抗荧光淬灭封片液(含Hoechst 33342)

BioReagent,适用于免疫组织化学(for IHC),适用于免疫荧光(IF)

适合荧光TUNEL与Hoechst核定位联合判读

封片与成像

A1209362

抗荧光淬灭封片液(含PI)

BioReagent,适用于免疫荧光(IF),适用于免疫组织化学(for IHC)

适合荧光TUNEL联合PI观察核损伤和晚期死亡相关信号

封片与成像

P1508975

聚乙烯醇抗荧光淬灭封片剂

适用于免疫荧光(IF),BioReagent,用于显微镜,适用于荧光分析

适合荧光TUNEL长期保存和降低荧光淬灭

封片与成像

F1508973

Fischor封片剂

BioReagent,用于显微镜,适用于免疫荧光(IF),适用于免疫组织化学(for IHC)

适合显色法或部分荧光法TUNEL终点封片

封片与成像

M292692

封片剂

无香型

适合常规TUNEL成像后的基础封片处理

封片与成像

C1508971

常规甘油封片剂

BioReagent,用于显微镜,适用于免疫荧光(IF),适用于荧光分析

适合基础荧光TUNEL封片

封片与成像

G1508970

甘油PBS封片剂

BioReagent,用于显微镜,适用于免疫荧光(IF),适用于荧光分析

适合常规荧光TUNEL样本封片

封片与成像

P1508974

聚乙烯醇甘油封片剂

BioReagent,用于显微镜,适用于免疫荧光(IF),适用于免疫组织化学(for IHC)

适合TUNEL切片封片与中短期保存

封片与成像

A1508972

阿拉伯树胶甘油封片剂

BioReagent,用于显微镜,适用于微生物学,适用于免疫荧光(IF),适用于免疫组织化学(for IHC)

适合常规显微观察型TUNEL样本封片

 

        TUNEL法的实验价值,在于将DNA断裂这一凋亡相关事件稳定转化为可观察信号;其判读难点也正来自DNA断裂并非凋亡专属现象。可靠的TUNEL结果,不取决于信号是否最强,而取决于核定位是否明确、形态学是否一致、对照是否成立以及联合指标是否支撑解释。

 

更多相关文章,详见下方:

[1] 显微镜形态学观察细胞凋亡

[2] AO 染色法(丫啶橙染色法)检测细胞凋亡

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引用本文

阿拉丁科学.《细胞凋亡检测中的TUNEL标记与结果判读》. 阿拉丁知识库,更新于 2026年4月22日。 https://www.aladdin-e.com/zh_cn/faqs/cell-apoptosis-detection-by-tunel-labeling.html
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