小分子抑制剂科研选型指南：最小证据链与场景化验证框架（含选型矩阵、案例卡片与产品表1–表4）
小分子抑制剂科研选型指南：最小证据链与场景化验证框架（含选型矩阵、案例卡片与产品表1–表4）
1. 小分子抑制剂是什么？为什么科研里要讲“证据链”？
1）什么叫“抑制剂”？
- 在化学与生物化学语境中，抑制剂（inhibitor）指能使某个过程的速率降低的物质；在酶体系里，常见表现为与酶结合，从而降低催化速率。IUPAC 对 inhibitor 的定义本质上就是“降低反应速率的物质”。
- 而小分子抑制剂通常指分子量相对较小、可化学合成（或天然来源）的化合物，用于在细胞或体内干预某个蛋白（如激酶、受体、离子通道、代谢酶等）的功能，从而改变通路输出或表型。
- 小结：抑制剂不是“某个神奇分子”，而是一个可检验的干预工具：它必须在体系里“以可解释的方式”让目标功能下降。
- 注：本文为便于科研选型，将‘降低靶点功能输出’的工具小分子统称为抑制剂；对受体/离子通道等体系，更严格术语可分别对应拮抗剂/阻断剂/调节剂。
2）为什么科研里必须谈“证据链”？
实验里最常见的误区是：
- 看到某个抑制剂“能让表型变了”，就直接写成“靶点导致表型”；
- 或者只盯一个 IC₅₀/EC₅₀ 数字，忽略了“它是否真的打中靶点、是否脱靶、是否到达作用位点”。
在真实体系中，表型变化可能来自：
- 脱靶效应（同家族蛋白也被抑了）；
- 暴露不足或析出（体外强、细胞里不灵）；
- 毒性/应激（看似有效其实是系统崩了）；
- 化学身份差异（盐型、对映体、纯度、批次导致重现性差）。
因此，科研选型需要一条顺序明确的“最小证据链”：是为了用最少的信息，最大幅度降低误判与不可重复。
2. 最小证据链：从“可解释”到“可复现”的选型路径
当拿到一个抑制剂（或准备采购）时，建议按 Step 1→7 走一遍：Step 1–4 用来把“效应是否可归因于目标靶点”钉住（身份、体外活性、细胞内 on-target、选择性/正交对照）；Step 5–7 用来把“能否在你的体系里稳定复现”做实（暴露/溶解与析出、关键风险、批间与供应一致性）。
步骤（Step） | 核心检查点 | 需要确认/获取的信息 | 如果省略可能的后果 | 常见误区 |
Step 1 | 化学身份一致性 | 结构、纯度、盐型/水合物、立体化学（对映体/比例）、批次信息 | 同名异物导致活性/溶解度/暴露不可比；批次差异使结果难复现 | 只按名称/CAS，下结论不标盐型与对映体 |
Step 2 | 体外靶点活性成立 | IC₅₀/Ki/Kd 或功能读数；关键测定条件（底物/ATP、时间、读出方式）；IC₅₀不是“化合物常数 | 难区分“靶点不成立”与“体系不匹配”；后续阴性无法定位原因 | 用单一 IC₅₀跨体系硬比较 |
Step 3 | 细胞内 on-target 证据 | target engagement（占有/结合）或贴靶点标志物的剂量/时间反应；必要时救援实验 | 表型难归因：脱靶/毒性/应激可伪装为“有效抑制” | 只看表型，不建立靶点链条 |
Step 4 | 选择性与脱靶约束 | 同家族/全谱面板；关键脱靶；正交化合物（不同骨架）一致性； | 机制解释不可控：效应可能来自并行抑制多个靶点 | 高浓度“扫射式抑制”当成靶点效应 |
Step 5 | 暴露与可用性达标 | 溶解度/析出、稳定性、渗透/外排；（CNS）脑暴露；清除率/半衰期 | 体外强但细胞/体内无效时无法判断“药效不足”还是“到达不足” | 忽略析出/吸附，盲目加浓度 |
Step 6 | 关键风险可控 | CYP TDI/代谢抑制、hERG/毒性提示、反应性、聚集/信号干扰风险 | 假阳性与不可解释副作用增加；体内/长期处理失败率上升 | 把“效应强”误判为“机制强” |
Step 7 | 可持续获得与批间一致性 | 路线关键步骤风险、原料可得性、放大与批间一致性、供应链 | 难以长期复现与扩展；关键分子供货不稳导致项目中断 | 只看一次性样品，不评估后续可获得性 |
补充：
Step 4 正交化合物（不同骨架）一致性：优先：同靶点不同骨架（orthogonal scaffold）一致性；其次：失活对照（如构效明确的失活类似物/对映体）；再其次：遗传学一致性。
3. 选型矩阵（用途 × 靶点对象）：优先证据与关键读数
实验任务（用途） | 激酶抑制剂（SIK/IRAK4/CK1δ） | 非激酶酶抑制剂（如 EBP） | 离子通道抑制剂（如 ClC-1） |
A 因果验证（靶点是否导致表型） | 优先证据：同家族/kinome 选择性 + 细胞内贴靶点标志物剂量曲线；最好配正交化合物/失活对照 | 优先证据：直接 target engagement（底物/代谢物与剂量×时间闭环）+ 救援/对照 | 优先证据：功能读数（电流/兴奋性）与表型一致的剂量窗 + 亚型/组织选择性 |
B 通路定位（是否参与、上下游定位） | 关键读数：p-底物时间序列；避免高浓度“扫射”；用第二个骨架确认趋势 | 关键读数：贴通路的近端代谢读数优先；远端表型只作为支持 | 关键读数：电生理/功能读数先行；表型解释需绑定通道功能变化 |
C 体内/组织可达（CNS/体内/组织暴露） | 先决条件（先过关再谈机制）：先确认组织/脑暴露（最好是脑内游离/可用浓度）与清除率/半衰期是否能覆盖体外效力范围；满足后再谈选择性与机制归因 | 先决条件（先过关再谈表型）：先确认体内暴露是否“可控且不过度积累”（半衰期不是越长越好），并用体内近端化学/代谢标志物证明 engagement；再讨论远端表型 | 先决条件（先过关再谈临床相关表型）：先确认组织/亚型选择性与“功能性剂量窗”（通常追求部分抑制即可）；满足后再把通道功能变化映射到表型 |
4. 五个高频场景：抑制剂选型的“三步最小验证路径”
高频场景（用途 + 靶点对象） | Step 1｜证据核对 | Step 2｜关键读数 | Step 3｜对照约束 | 通过判据（一句话） | 对应下文案例卡片 |
因果验证 × 激酶（如 SIK/IRAK4/CK1δ） | 是否有同家族/kinome 选择性数据；是否有细胞内贴靶点标志物 | 做贴靶点标志物的剂量-反应（并同步做存活/应激底线） | 用正交化合物或失活对照做一致性；并把浓度限制在选择性窗口内 | “表型随贴靶点标志物变化且在选择性窗口内可复现” | 卡片 1（GLPG3970） |
性质门槛（CNS/体内）× 激酶 | 是否有脑暴露/可用浓度（Kp,uu 等）或明确 CNS 渗透证据 | 在体内/脑组织建立 PD/占有或近端通路 readout | 用“脑内游离浓度 vs 体外效力/选择性”做一致性校验 | “脑内游离暴露足以覆盖效力且不靠脱靶浓度堆出来” | 卡片 2（BIO-7488）/卡片 5（CK1δ） |
因果验证 × 非激酶酶（如代谢酶 EBP） | 是否有直接 TE 证据路径（底物/代谢物/近端标志物） | 做“剂量 × 时间”耦合：近端代谢读数随剂量/时间可预测变化 | 加入旁路/救援或替代解释排除（至少做到“近端读数先变，远端表型后变”） | “TE 闭环成立，且表型能被近端证据支撑” | 卡片 3（EBP 11） |
性质门槛 × 非激酶酶（体内可用性/暴露形状） | 是否有暴露形状（清除/半衰期/口服）及积累风险提示 | 体内用近端代谢标志物验证 engagement（而非只看远端表型） | 校验“暴露形状是否适配目的”（半衰期不是越长越好） | “体内 engagement 可重复且暴露形状可控” | 卡片 3（EBP 11） |
因果/定位 × 离子通道（如 ClC-1） | 是否有通道亚型/组织选择性信息；是否有功能性剂量窗数据 | 先做功能读数（电生理/兴奋性），再连接到表型 | 约束“部分抑制”的安全/有效窗口，避免全抑 | “功能读数与表型一致且存在可控剂量窗” | 卡片 4（NMD670） |
5. 五张案例卡片
卡片 1｜GLPG3970（SIK2/SIK3）：同家族里“抑得准”才能做因果验证
1. 适用场景：因果验证 × 激酶（同家族激酶：SIK1/2/3）
2. 本卡片聚焦的关键问题：
- 当靶点属于同一激酶家族时，如何避免“把家族成员一起抑了”导致表型不可归因？
3. 优先核对的关键证据
- 同家族选择性：是否对 SIK2/3 强、对 SIK1 相对弱（GLPG3970 在文献中描述为 SIK2/SIK3 双抑制且对 SIK1 具选择性；并给出 IC₅₀ 量级差异）。
- 细胞内贴靶点读数：与 SIK 通路相关的近端 readout 有剂量依赖。
- 归因约束：至少具备一种“第二把尺子”（正交化合物/失活对照/遗传学一致性之一）。
4. 推荐的最小行动路径（可按体系微调）
- 先做近端 readout 的剂量-反应（比先看终点表型更能快速判断“是否打中”）。
- 把工作浓度限制在“选择性仍然成立”的窗口（避免高浓度把 SIK1 等一起扫到）。
- 一致性约束：换一个不同骨架的 SIK 抑制剂或用遗传学手段做方向一致验证。
5. 需要谨慎的信号（建议先排查）
- 只有在明显偏高的浓度才出现表型，但近端 readout 不随剂量规律变化；或“起效浓度”已明显超出同家族选择性窗口。
6. Primary reference
- Peixoto C, et al. Journal of Medicinal Chemistry (2024). DOI: 10.1021/acs.jmedchem.3c02246.
卡片 2｜BIO-7488（IRAK4）：CNS 项目先证明“到得了脑”，再谈机制归因
1. 适用场景：体内/组织可达（CNS）× 激酶（IRAK4；中枢神经炎症相关应用语境）
2. 本卡片聚焦的关键问题：
- 在 CNS 项目里，“体外强”不等于“中枢可用”。如何把结论约束在脑内可用暴露与脑内/中枢相关 PD 链条之内，避免用不成立的暴露窗口硬推机制？
3. 优先核对的关键证据
- CNS 渗透/脑暴露证据：是否明确描述其为 CNS-penetrant，并给出与 CNS 场景相匹配的 PK/暴露信息（至少能支持“能进脑”的结论）。
- 脑内/中枢相关近端 PD 读数：是否有 IRAK4 通路相关的近端 readout（而非只看远端表型），并能与剂量/时间关联。
- 选择性/浓度约束：是否有选择性底线或面板信息，或至少能说明不是靠“堆到很高浓度”才看到效应。
4. 推荐的最小行动路径（可按体系微调）
- 先问暴露：若缺少 CNS 暴露信息，先把该分子定位为“体外/通路工具”，不要直接下“中枢因果”结论。
- 再做中枢相关近端 PD：在中枢相关细胞/组织/模型中建立 IRAK4 近端 readout 的剂量-反应或时间-反应。
- 用“可用暴露覆盖效力”约束解释：将你使用的浓度/剂量与脑内可用暴露范围对齐，避免脱靶浓度解释。
5. 需要谨慎的信号（建议先排查）
- 只有在明显偏高、难以被暴露证据支持的剂量/浓度下才出现效应；或近端 PD 与表型脱耦（PD 不动、表型动）。
6. Primary reference
- Evans R, et al. Journal of Medicinal Chemistry (2024). DOI: 10.1021/acs.jmedchem.3c02226.
卡片 3｜EBP 抑制剂 11：代谢/生物合成通路里，先把 TE（近端证据）闭环做硬
1. 适用场景：因果验证 × 非激酶酶（EBP；胆固醇生物合成通路相关；也常连到体内/脑可达语境）
2. 本卡片聚焦的关键问题：
非激酶酶/代谢通路中，远端表型容易被旁路解释。如何用target engagement（TE）近端证据闭环把“确实抑到靶点”钉住，再讨论表型归因？
3. 优先核对的关键证据
- 近端 TE 证据路径：是否能用底物/代谢物或更近端的化学/生物标志物体现 EBP engagement（而非只看远端表型）。
- 剂量 × 时间耦合：近端指标是否随剂量、随时间呈规律变化（能形成闭环证据链）。
- 替代解释约束：至少能做到“近端先变、远端后变”的顺序逻辑；必要时配合救援/旁路对照以减少歧义。
4. 推荐的最小行动路径（可按体系微调）
- 优先建立近端 readout：先选底物/代谢物/近端标志物作为主 readout，而不是一上来只看终点表型。
- 做小型剂量×时间矩阵：2–3 个剂量 × 2–3 个时间点，先把趋势做硬（比单点更可靠）。
- 用顺序逻辑收束因果：先证明 TE 闭环成立，再讨论远端表型是否能被该 TE 合理解释。
5. 需要谨慎的信号（建议先排查）
- 远端表型变化明显，但近端 TE 指标不随剂量/时间规律变化（提示旁路/应激或非特异作用的可能）。
6. Primary reference
- Dorel R, et al. Journal of Medicinal Chemistry (2024). DOI: 10.1021/acs.jmedchem.3c02396.
卡片 4｜NMD670（ClC-1）：通道类先“功能剂量窗”，再把功能变化连接到表型
1. 适用场景：因果/定位 × 离子通道（ClC-1；骨骼肌兴奋性与肌无力相关语境）
2. 本卡片聚焦的关键问题：
- 离子通道抑制剂最常见误用是“先看表型、后补功能解释”。如何用功能读数先行与可控剂量窗（常为部分抑制），把表型解释建立在可复核的通道功能变化之上？
3. 优先核对的关键证据
- 功能读数证据：是否有电生理/兴奋性等功能 readout，并可形成剂量响应关系。
- 可控剂量窗：是否强调或支持“部分抑制即可有效”，而不是追求全抑（这与安全性/可解释性密切相关）。
- 组织/亚型选择性：是否对组织特异性或亚型选择性有交代，避免把系统推到高风险“全抑”区域。
4. 推荐的最小行动路径（可按体系微调）
- 先做功能 readout 的剂量-反应（至少 5 点剂量），确定有效区间与上限。
- 再把功能变化映射到表型：顺序固定为“功能 → 表型”，避免倒置。
- 用“部分抑制窗口”约束用量：尽量在可解释、可控窗口内完成验证，而非用全抑浓度做推断。
5. 需要谨慎的信号（建议先排查）
- 只有在接近饱和/全抑的高浓度才出现表型，且伴随明显非特异反应或体系不稳定。
6. Primary reference
- Skov M, et al. Science Translational Medicine (2024). DOI: 10.1126/scitranslmed.adk9109.
卡片 5｜CK1δ 抑制剂（Janssen）：先核对“选择性证据够不够硬”，再谈体内/脑可达
1. 适用场景：因果验证 × 激酶 或 体内/脑可达 × 激酶（CK1δ；以“高选择性 + 脑穿透/体内可用性”为目标的工具分子语境）
2. 本卡片聚焦的关键问题：
- 当希望把某激酶抑制剂当作“高置信工具分子”使用时，核心前提往往是：选择性证据是否足够硬（面板/结构/结合模式等）。在此基础上，若用于 CNS/体内，还需要暴露与 engagement 链条把解释空间锁住。
3. 优先核对的关键证据
- 选择性支撑：是否有选择性面板（kinome 或同等强度证据），并能说明选择性来自明确的结合模式/结构设计逻辑。
- （如用于 CNS）脑暴露与 engagement：是否给出 brain exposure 与 target engagement 相关信息，支持其作为 CNS 工具分子的前提。
- 细胞/组织近端 readout：是否存在贴靶点读数，用于把“体外/细胞”链条闭起来，避免只用远端表型推断。
4. 推荐的最小行动路径（可按体系微调）
- 先核对选择性证据是否齐备：若缺少面板/结构支撑，应降低结论强度（更适合做通路提示而非因果归因）。
- 再做近端 readout 的剂量-反应：确认在可控浓度范围内有规律响应。
- 若用于 CNS/体内：用“可用暴露覆盖效力与选择性窗口”的逻辑约束用量与解释，避免脱靶浓度。
5. 需要谨慎的信号（建议先排查）
- 选择性证据不足但直接下“靶点因果”结论；或 CNS 场景缺少暴露/engagement 链条却直接做机制归因。
6. Primary reference
- McCarver S, et al. ACS Medicinal Chemistry Letters (2024). DOI: 10.1021/acsmedchemlett.3c00523.
小结：
这 5 张卡片覆盖了科研中最常见的 5 类抑制剂使用场景：
- 同家族激酶：先控选择性窗口，再谈因果归因；
- CNS/体内：先过“到达与停留”，再谈机制；
- 代谢酶：先做 target engagement 近端闭环，再谈远端表型；
- 离子通道：功能读数先行，找到可控剂量窗；
- 需要高置信工具分子：先核对选择性证据是否足够硬，再谈下结论。
要点：
- 因果验证的核心不是“表型变了”，而是“on-target 证据 + 选择性约束”。
- 体内/CNS 的核心不是“体外更强”，而是“可用暴露能覆盖效力与选择性窗口”。
- 通道与代谢酶的核心不是“讲机制更复杂”，而是“读数更贴近靶点/功能”。
6. 产品选型导航表｜小分子抑制剂：按实验任务快速定位表1–表4
需求/场景 | 优先看哪张表 | 为什么这张表最合适 | 在这张表里能快速找到什么 |
已经有一个通路假设：想快速验证 ERK/p38/PI3K-AKT-mTOR/ROCK/JAK 等信号轴是否驱动表型（“一加药就知道是不是它”） | 表1｜信号通路与靶向治疗抑制剂 | 表1按“靶点/通路节点”给出主流抑制剂，最适合做因果验证与定位节点（上游/中游/下游对照） | PD98059 / PD0325901 / U0126（ERK轴）；SB202190 / SB203580（p38）；LY294002类/渥曼青霉素（PI3K）；MK-2206（AKT）；雷帕霉素（mTORC1）；Y-27632（ROCK）；托法替尼/鲁索替尼（JAK）；以及星形孢菌素等阳性对照 |
要做 肿瘤靶向抑制剂对照/药敏：EGFR、BCR-ABL、BRAF、BTK、CDK4/6、PARP 等“临床相关靶点”在我的模型里是否成立 | 表1｜信号通路与靶向治疗抑制剂 | 表1集中放“临床靶点抑制剂 + 经典通路抑制剂”，适合做药敏对照、靶点依赖性验证与组合策略初筛 | 吉非替尼/埃罗替尼（EGFR）；伊马替尼/伊马替尼甲磺酸盐（BCR-ABL等）；维罗非尼（BRAF）；依鲁替尼（BTK）；帕波西利（CDK4/6）；奥拉帕尼（PARP） |
项目是 表观遗传/转录依赖性：想验证“乙酰化/溴结构域/去乙酰化”是否是关键旋钮，或做转录重编程相关的抑制剂组合 | 表2｜表观遗传与蛋白稳态调控抑制剂 | 表2把 HDAC / BET / Sirtuin 等“转录层面旋钮”集中在一起，适合快速做方向性验证与组合对照 | TSA、SAHA类（HDAC）；(+)-JQ1（BET）；烟酰胺（Sirtuin 相关工具分子） |
怀疑表型来自 蛋白降解/蛋白稳态（UPS/蛋白酶/溶酶体相关），需要判断“是合成少了，还是降解快了”，或要在裂解/纯化时保护蛋白 | 表2（蛋白酶体/蛋白酶）+ 表3（自噬/溶酶体） | 表2更偏“UPS/蛋白酶抑制”；表3更偏“细胞器与通量步骤”。两张表搭配能把降解路径拆清楚 | MG-132（蛋白酶体）；E-64（半胱氨酸蛋白酶）；硼替佐米类；以及表3中的巴佛洛霉素A1/氯喹（溶酶体酸化/通量） |
要做 自噬通量判读：区分“自噬被诱导了”还是“降解被堵了”，或在 mTOR 抑制背景下验证通量 | 表3｜细胞过程工具分子（含自噬-溶酶体） +（配合）表1 的雷帕霉素 | 自噬实验最怕把“LC3上升”误判为“自噬增强”，表3提供末端阻断与通量工具；再用表1的雷帕霉素做诱导端对照更稳 | 巴佛洛霉素A1（V-ATPase，末端阻断）；磷酸氯喹（溶酶体相关）；雷帕霉素（诱导端/通路端） |
需要做 细胞周期/有丝分裂/骨架 相关验证：例如增殖下降到底是“通路抑制”还是“微管/周期被直接打断” | 表3｜细胞过程工具分子 | 表3集中微管与周期工具分子，适合做“机制排查对照组”避免误把细胞毒性当作靶点效应 | 秋水仙碱/诺考达唑（微管去稳态/去聚合）；紫杉醇（微管稳定）；Y-27632（骨架/收缩相关，亦可辅助解释黏附/迁移变化） |
做的是 转录/翻译依赖性验证：表型是否需要新转录？蛋白下降是合成停了还是降解快了？ | 表3｜细胞过程工具分子 | 表3提供“转录关/翻译关”工具，适合做最小因果拆解（尤其配合抑制剂处理的时间窗） | 放线菌素D（转录抑制）；CHX（蛋白翻译抑制，用于半衰期/CHX chase）；嘌呤霉素（筛选/亦可用于蛋白合成读出体系） |
做的是 分泌/膜转运/高尔基体相关表型（受体上膜、分泌因子依赖、细胞表面蛋白变化），担心抑制剂表型其实是运输被影响 | 表3｜细胞过程工具分子 | 表3包含 ER-Golgi 运输阻断工具，适合快速做“运输依赖性”排查对照 | 布雷非德菌素A（ER-Golgi 转运/分泌通路抑制） |
需要把抑制剂实验做“更稳”：裂解后磷酸化信号不掉、LC-MS 条件一致、样品前处理可重复、疏水抑制剂更好溶 | 表4｜通用配套与保护试剂 | 表4是“实验可重复性基础设施”：缓冲/挥发性添加剂、磷酸化保护、增溶、巯基捕获、辅因子都在这里 | NaF/正钒酸盐/焦磷酸盐/β-甘油磷酸盐（磷酸化保护）；甲酸/乙酸铵/甲酸铵/碳酸氢铵（LC-MS/样品体系）；HP-β-CD（增溶）；GSH/NAC/半胱氨酸（反应性排查）；NADPH（酶学/代谢体系） |
怀疑抑制剂带来的是 ROS/电亲性应激/反应性代谢物，需要做“是不是 off-target 化学反应”排查 | 表4｜通用配套与保护试剂（配合表2/表1读出） | 表4提供“捕获/缓冲/辅因子”，能快速做反应性风险对照，避免把化学应激误当靶点效应 | GSH、NAC、半胱氨酸（硫醇捕获/解毒对照）；DPI（ROS/黄素酶工具）；NADPH（代谢/氧化还原体系） |
使用建议：
如果目标是“先定位通路/靶点”，先看 表1；如果担心“表型来自表观遗传/蛋白稳态”，看 表2；如果要做“细胞过程机制拆解（周期/自噬/转运/转录翻译）”，看 表3；如果要把实验做稳、做可重复，或做反应性排查，优先看 表4。
表1｜信号通路与靶向治疗抑制剂（激酶/DDR/肿瘤靶向）
分类 | Cas编号 | 阿拉丁货号 | 名称 | 规格或纯度 | 产品特色/选型要点（小分子抑制剂实验） |
激酶通路抑制剂｜MAPK/ERK 轴 | 167869-21-8 | PD 98059（DMSO溶液） | Moligand™, 10 mM | MEK1 抑制剂（经典 ERK 通路工具分子）；10 mM DMSO 预配液便于直接稀释做细胞实验，适合快速建立“ERK 依赖性”因果链与剂量梯度。 | |
激酶通路抑制剂｜MAPK/ERK 轴 | 391210-10-9 | PD0325901,MEK1 / 2的抑制剂 | Moligand™, ≥99% | 高效 MEK1/2 抑制剂；用于 ERK 通路强抑制与耐药模型（与 PD98059、U0126 可形成“不同代际/不同位点抑制”对照）。 | |
激酶通路抑制剂｜MAPK/ERK 轴 | 109511-58-2 | U0126,MKK抑制剂 | Moligand™, ≥98% | 常用 MEK1/2 抑制剂（ERK 通路工具分子）；与 PD98059/PD0325901 做并行可增强结论稳健性（不同化学型/抑制谱）。 | |
激酶通路抑制剂｜p38 MAPK | 152121-30-7 | SB 202190,p38 MAPK抑制剂 | Moligand™, ≥99% | 经典 p38 抑制剂；用于炎症因子、应激信号与分化相关表型验证；适合与 SB-203580 做并行对照减少“单分子偏差”。 | |
激酶通路抑制剂｜p38 MAPK | 152121-47-6 | SB-203580,p38 MAPK抑制剂 | Moligand™, ≥98%(HPLC) | 经典 p38α/β 抑制剂；与 SB202190 一起常用于“p38 依赖性”双探针策略，提高因果判断稳健性。 | |
激酶通路抑制剂｜PI3K | 154447-36-6 | 2-吗啉代-8-苯基色酮 | Moligand™, ≥98% | 常见 PI3K 抑制剂（LY294002 类）；用于 PI3K-AKT-mTOR 轴的通路阻断与表型验证（可与 MK-2206、渥曼青霉素形成“轴内不同节点/不同化学型”对照）。 | |
激酶通路抑制剂｜PI3K | 19545-26-7 | 渥曼青霉素 | Moligand™, ≥98% | 经典 PI3K 抑制剂（不可逆/强效工具分子）；适合做通路“强阻断”对照，与 LY294002/MK-2206 配对有助于定位轴内节点。 | |
激酶通路抑制剂｜AKT | 1032350-13-2 | MK-2206 2HCl | Moligand™, ≥98% | AKT 变构抑制剂；用于 PI3K-AKT 轴中间节点阻断，与 PI3K 抑制剂（LY294002/渥曼青霉素）形成“上游 vs 中游”对照，利于定位表型来源。 | |
蛋白稳态/信号抑制剂｜mTORC1 | 53123-88-9 | 雷帕霉素 | Moligand™, ≥98%(HPLC) | mTORC1 抑制剂；用于自噬/代谢重编程/生长信号验证；常与巴佛洛霉素A1（阻断溶酶体酸化）组合做“自噬通量”判读。 | |
激酶通路抑制剂｜ROCK | 146986-50-7 | Y-27632 | Moligand™, ≥98% | ROCK 抑制剂；常用于细胞骨架/收缩相关表型、以及干细胞/原代细胞传代“提高存活率”的条件优化（注意对黏附/迁移读数的影响）。 | |
靶向治疗抑制剂｜JAK | 477600-75-2 | 托法替尼(CP-690550) | Moligand™, ≥98%(HPLC) | JAK 抑制剂；用于细胞因子-STAT 信号通路抑制、免疫/炎症模型；适合与鲁索替尼构成“JAK 抑制剂对照组”。 | |
靶向治疗抑制剂｜JAK1/2 | 941678-49-5 | 鲁索替尼 (INCB018424) | Moligand™, ≥98% | JAK1/2 抑制剂；用于细胞因子-STAT 轴验证、炎症/免疫模型；与托法替尼可做“不同 JAK 偏好/谱系”的对照。 | |
靶向治疗抑制剂｜CDK4/6 | 571190-30-2 | 帕波西利 | Moligand™, ≥99% | CDK4/6 抑制剂；用于细胞周期 G1 阻滞、RB 通路依赖性验证；常与增殖读数（EdU/Ki67/细胞周期流式）联用。 | |
靶向治疗抑制剂｜BCR-ABL/c-KIT | 152459-95-5 | 伊马替尼 | Moligand™, ≥99% | 代表性酪氨酸激酶抑制剂（BCR-ABL/c-KIT/PDGFR）；常用于肿瘤信号依赖性验证与阳性对照；与“伊马替尼甲磺酸盐”在溶解度/配制便利性上可互补。 | |
靶向治疗抑制剂｜BCR-ABL/c-KIT（盐型） | 220127-57-1 | 伊马替尼甲磺酸盐 | ≥99% | 伊马替尼盐型：通常更利于称量/溶解与配制稳定性；用于与伊马替尼游离碱做“同分子不同盐型”对照或按体系选择更顺手的配制方式。 | |
靶向治疗抑制剂｜EGFR | 184475-35-2 | 吉非替尼 (ZD1839) | Moligand™, ≥99% | 经典 EGFR 抑制剂；适合 EGFR 驱动细胞系的通路阻断与药敏对照（与埃罗替尼可做同靶点不同分子对照）。 | |
靶向治疗抑制剂｜EGFR | 183321-74-6 | 埃罗替尼 | Moligand™, ≥98% | EGFR 抑制剂；与吉非替尼构成“同靶点不同分子”对照，便于排除单化学型偏差并验证 EGFR 驱动依赖性。 | |
靶向治疗抑制剂｜BTK | 936563-96-1 | 依鲁替尼 (PCI-32765) | Moligand™, ≥98% | BTK 抑制剂；用于 BCR 信号、免疫细胞活化与 B 细胞肿瘤模型的通路验证；适合做 BTK 依赖性阳性对照。 | |
靶向治疗抑制剂｜BRAF(V600E) | 918504-65-1 | 维罗非尼(PLX4032,RG7204) | Moligand™, ≥98% | BRAF(V600E) 抑制剂；用于 MAPK 通路依赖性肿瘤模型与耐药机制研究；适合做 BRAF 突变依赖性阳性对照。 | |
DNA 修复抑制剂｜PARP | 763113-22-0 | 奥拉帕尼 (AZD2281, Ku-0059436) | Moligand™, ≥98% | PARP 抑制剂；用于 DNA 损伤修复依赖性验证、与铂类/放疗/DDR 通路联用研究，以及合成致死（BRCA/HRD）相关模型。 | |
广谱激酶抑制剂｜阳性对照 | 62996-74-1 | 星形孢菌素 | Moligand™, ≥98% | 经典 广谱蛋白激酶抑制剂；常作“强抑制/凋亡诱导”阳性对照或筛选体系质控（不适合用来做精确靶点归因）。 | |
激酶通路抑制剂｜JNK | 129-56-6 | 蒽[1,9-cd]吡唑-6(2H)-酮 | Moligand™, ≥98% | 该骨架常作为 JNK 抑制剂工具分子（SP600125 类）；用于应激-炎症-凋亡相关通路验证（注意常见的激酶谱外作用，建议配合正交对照）。 |
表2｜表观遗传与蛋白稳态调控抑制剂（Sirtuin/HDAC/BET/蛋白酶体/蛋白酶）
分类 | Cas编号 | 阿拉丁货号 | 名称 | 规格或纯度 | 产品特色/选型要点（小分子抑制剂实验） |
表观遗传/代谢｜NAD 相关工具分子 | 98-92-0 | 烟酰胺 | 用于细胞培养, 用于昆虫细胞培养, ≥99.5%(HPLC) | NAD⁺ 相关代谢物；在表观遗传研究中常作 Sirtuin（SIRT）去乙酰化酶的经典工具抑制剂/调节剂（同时也会影响多种 NAD⁺ 依赖过程），适合做“去乙酰化轴”快速干预或补料对照。 | |
表观遗传抑制剂｜HDAC | 149647-78-9 | N-羟基-N'-苯基辛二酰胺 | Moligand™, ≥99% | 常见 HDAC 抑制剂骨架（SAHA/vorinostat 类）；用于表观遗传调控、转录重编程与增殖抑制研究，适合做“乙酰化↑/HDAC 依赖性”验证。 | |
表观遗传抑制剂｜HDAC | 58880-19-6 | 曲古柳菌素A(TSA) | Moligand™, ≥98% | 高效 HDAC 抑制剂；用于乙酰化上调、转录重塑、表观遗传依赖性验证（与 SAHA 可做“强效 vs 相对温和”对照）。 | |
表观遗传抑制剂｜BET 溴结构域 | 1268524-70-4 | (+)-JQ1,BET溴结构域抑制剂 | ≥98%(HPLC) | 经典 BET（BRD2/3/4）溴结构域抑制剂；用于转录依赖性/超级增强子相关靶基因验证，常与 HDAC 抑制剂形成表观遗传组合对照。 | |
蛋白酶抑制剂｜Cys 蛋白酶 | 66701-25-5 | E-64,半胱氨酸蛋白酶抑制剂 | Moligand™, ≥99%, protease inhibitor | 典型不可逆 半胱氨酸蛋白酶抑制剂；常用于裂解/纯化时抑制蛋白降解、稳定靶蛋白，或作为溶酶体/蛋白酶体相关研究的对照组分。 | |
蛋白稳态抑制剂｜蛋白酶体 | 133407-82-6 | MG-132,可逆蛋白酶体抑制剂 | Moligand™, ≥98% | 经典 可逆蛋白酶体抑制剂；用于累积泛素化蛋白、验证 UPS 依赖降解、以及与自噬通路做交叉对照（注意对其他蛋白酶也可能有交叉抑制）。 | |
蛋白稳态抑制剂｜蛋白酶体 | 179324-69-7 | Bortezomib (PS-341) | Moligand™, ≥98% | 典型蛋白酶体抑制剂，用于抑制 UPS 降解通路、快速累积泛素化/短寿命蛋白，验证“表型是否依赖蛋白酶体介导降解”；常与 MG-132（化学型不同）做正交对照，或与自噬/溶酶体抑制剂联用区分“蛋白酶体 vs 溶酶体”贡献。 |
表3｜细胞过程工具分子（骨架/周期/转录/翻译/运输/自噬-溶酶体/钙信号）
分类 | Cas编号 | 阿拉丁货号 | 名称 | 规格或纯度 | 产品特色/选型要点（小分子抑制剂实验） |
细胞培养工具｜选择压力/翻译抑制 | 58-58-2 | 嘌呤霉素 | 用于细胞培养, Ready Made Solution, from Streptomyces alboniger,10 mg/mL in H2O | 细胞筛选常用抗生素：用于稳定株/慢病毒转导后的 嘌呤霉素抗性筛选；也可用于 SUnSET 等蛋白合成读出（需注意毒性窗口与不同细胞系敏感性差异）。 | |
细胞培养工具｜转录抑制/半衰期测定 | 50-76-0 | 放线菌素 D | 用于细胞培养, from Streptomyces sp. | 经典 转录抑制剂；常用于 RNA 半衰期/转录依赖性验证（如抑制剂处理后表型是否需要新转录）；毒性强，适合做短时、低剂量窗口实验。 | |
细胞培养工具｜翻译抑制/CHX chase | 66-81-9 | "3-[2-(3,5-二甲基-2-氧代环己基)-2-羧基乙基]戊二酰胺 " | Moligand™, ≥98% | 典型 蛋白翻译延伸抑制剂（Cycloheximide, CHX）：用于 CHX-chase 测蛋白半衰期、区分“合成 vs 降解”贡献；强抑制，注意时间窗与毒性。 | |
细胞骨架/有丝分裂工具 | 64-86-8 | 秋水仙碱 | Moligand™, 用于植物细胞培养, ≥98%(HPLC) | 微管聚合抑制/纺锤体破坏工具分子；常用于细胞周期阻断、有丝分裂相关通路验证（与紫杉醇形成“微管抑制 vs 稳定”对照）。 | |
细胞骨架/有丝分裂工具 | 33069-62-4 | 紫杉醇 | Moligand™, 分析标准品, ≥99% | 微管稳定剂；常用于细胞周期/凋亡通路工具分子（与秋水仙碱/诺考达唑构成微管相关对照组），也常作阳性对照评估“抑制剂诱导的增殖抑制/细胞死亡”。 | |
细胞骨架/有丝分裂工具 | 31430-18-9 | 诺考达唑 | ≥98% | 微管去聚合剂；常用于细胞周期同步化、纺锤体检查点与有丝分裂阻断，对“抑制剂影响增殖/周期”的机制拆解很实用。 | |
分泌/转运工具｜ER-Golgi 运输抑制 | 20350-15-6 | 布雷非德菌素 A | ≥98%(HPLC), from Penicillium brefeldianum | 经典 ER-Golgi 转运/分泌通路抑制剂；用于验证表型是否依赖分泌/膜运输与高尔基体功能，在受体转运/分泌因子依赖的抑制剂研究中常用。 | |
溶酶体/自噬工具｜弱碱性积聚 | 50-63-5 | 磷酸氯喹 | ≥99% | 溶酶体蓄积的弱碱性化合物：常用于 抑制溶酶体酸化/干预自噬末端、影响内吞-溶酶体通路；适合做“自噬通量/溶酶体依赖性”对照（注意广泛细胞效应）。 | |
溶酶体/自噬通量工具｜V-ATPase | 88899-55-2 | 巴佛洛霉素A1 | ≥95% | V-ATPase 抑制剂：阻断溶酶体酸化与自噬体-溶酶体降解步骤；常与雷帕霉素/氯喹等组合区分“自噬诱导 vs 自噬通量阻断”。 | |
钙信号/应激工具｜SERCA | 67526-95-8 | 毒胡萝卜素 | Moligand™, ≥95% | 即 Thapsigargin：经典 SERCA（肌/内质网 Ca²⁺-ATPase）抑制剂，诱导内质网钙库释放与 ER stress；常用于 Ca²⁺ 信号、UPR/凋亡通路的工具性干预。 |
表4｜通用配套与保护试剂（LC-MS/缓冲盐/磷酸化保护/增溶/硫醇与辅因子）
分类 | Cas编号 | 阿拉丁货号 | 名称 | 规格或纯度 | 产品特色/选型要点（小分子抑制剂实验） |
分析/制备｜调pH与挥发性添加剂 | 64-19-7 | 冰乙酸 | 优级试剂, ≥99.5% | 常用于配缓冲液/调 pH、终止反应或酸化上样；用于小分子抑制剂样品前处理（酸化沉淀蛋白/提高重复性）与部分 LC 条件的挥发性酸源。 | |
分析/制备｜挥发性盐/LC-MS 体系 | 631-61-8 | 乙酸铵 溶液 | 医药级, PharmPure™, for IVD application | 典型挥发性缓冲盐；用于 LC-MS 流动相/样品缓冲与离子强度控制，常见于“抑制剂定量/代谢物分析/蛋白质组学样品处理”的通用体系。 | |
分析/制备｜LC-MS 常用酸 | 64-18-6 | 甲酸（FA） | 医药级, PharmPure™, ≥98% | LC-MS 最常用挥发性酸之一；用于流动相酸化、改善峰形/电喷雾响应，也常用于抑制剂处理后样品酸化终止与上机一致性控制。 | |
分析/制备｜挥发性盐/样品体系 | 540-69-2 | 甲酸铵 | 无水级, 试剂级, ≥97% | 常用挥发性缓冲盐（LC-MS 友好）；适合“抑制剂暴露-代谢/蛋白质组学/药代样品”中需要温和缓冲与兼容 MS 的场景。 | |
蛋白质组学/样品制备｜挥发性缓冲 | 1066-33-7 | 碳酸氢铵 | 试剂级 | 经典蛋白质组学消化缓冲（胰蛋白酶消化常用）；用于“抑制剂处理→蛋白组学/磷酸化组学”样品制备时的通用缓冲体系。 | |
递送/溶解｜增溶辅料 | 128446-35-5 | 环糊精HPB | PharmPure™, USP | HP-β-环糊精：疏水小分子（多类激酶抑制剂/天然产物类抑制剂等）的常用 增溶/递送辅料；适合配制水相工作液、动物给药或需要降低有机溶剂比例的场景。 | |
裂解/保护｜磷酸酶抑制添加剂 | 7681-49-4 | 氟化钠 | 优级试剂, ≥98% | 经典“裂解液/磷酸化保护”组分之一（抑制多类 Ser/Thr 磷酸酶活性）；常与正钒酸盐、焦磷酸盐、β-甘油磷酸盐等联用，减少抑制剂处理后信号回落。 | |
裂解/保护｜磷酸酶抑制添加剂 | 7722-88-5 | 焦磷酸钠 | AR, ≥99% | 常见裂解液添加剂：抑制多类磷酸酶/保护磷酸化状态；适合“抑制剂处理后做 WB/磷酸化读数”的样品制备。 | |
裂解/保护｜磷酸酶抑制添加剂 | 13408-09-8 | β-甘油磷酸钠溶液 | 0.5M | 经典 Ser/Thr 磷酸酶抑制/底物类似物；常用于裂解液保护磷酸化信号、提高通路抑制实验的可重复性。 | |
裂解/保护｜P-Tyr 保护关键添加剂 | 13721-39-6 | 正钒酸钠 | ≥99% | 经典 蛋白酪氨酸磷酸酶（PTP）抑制剂；与 NaF/焦磷酸盐/β-甘油磷酸盐配合，是“抑制剂-通路验证”里保持磷酸化信号的核心试剂。 | |
氧化还原/反应性评估｜硫醇捕获 | 52-90-4 | L-半胱氨酸 | UltraBio™, ≥98.5%(RT) | 常用“硫醇/亲核体”对照：用于评估电亲性抑制剂或反应性代谢物的 硫醇捕获/加成风险；也可用于培养体系的还原环境支持（需注意会影响红氧与金属离子状态）。 | |
氧化还原/反应性评估｜解毒/捕获 | 616-91-1 | N-乙酰-L-半胱氨酸（ NAC） | PharmPure™, USP, 欧洲药典（Ph.Eur）, ≥98.5% | 经典细胞内抗氧化/巯基供体；常用于 ROS/电亲性应激对照、以及“抑制剂是否诱导氧化应激/反应性中间体”的排查（也常用于 GSH 枯竭/补偿相关实验）。 | |
氧化还原/反应性评估｜硫醇体系 | 70-18-8 | 谷胱甘肽(还原型)（GSH） | Moligand™, 用于细胞培养, ≥98% | 细胞内关键硫醇缓冲体系；用于 反应性代谢物捕获/亲电性风险评估、氧化应激对照；也可用于体外酶学体系维持还原环境。 | |
氧化还原/酶抑制工具｜NOX/黄素酶 | 4673-26-1 | 氯化二亚苯基碘鎓 | Moligand™, ≥97% | 常用 黄素酶抑制工具分子，多用于抑制 NADPH oxidase（NOX）相关 ROS 生成；适合做“ROS 依赖性”排查对照（但选择性有限，需谨慎解释）。 | |
体外酶学/代谢体系｜辅因子 | 2646-71-1 | 还原辅酶Ⅱ四钠盐 水合物（β-NADPH四钠盐水合物） | ≥97%(HPLC) | NADPH：常用于氧化还原酶（CYP/还原酶/脱氢酶等）体系与代谢相关实验；在做“抑制剂-酶学 IC₅₀/代谢稳定性/ROS 生成”时是关键辅因子之一。 |
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